RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV6A0A075B6T7 132 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R20P59543 309 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GAS6Q14393 721 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A10Q63ZE4 541 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MZT2BQ6NZ67 158 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC20BQ86Y33 519 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51L1Q8NGJ5 315 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SUN5Q8TC36 379 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXW5Q969U6 566 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC120Q96HB5 630 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TSSK2Q96PF2 358 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB118Q96PH6 123 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CHST6Q9GZX3 395 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NOX4Q9NPH5 578 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL13Q9P2N7 655 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PQ72 361 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM74A7A6NL05 159 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ANXA2P2A6NMY6 339 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 H3BUI4 141 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAF2O60831 178 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 STX11O75558 287 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 AKR7A3O95154 331 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PRR5P85299 388 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM74A3Q4VXF1 159 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DCST2Q5T1A1 773 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C16orf62Q7Z3J2 963 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10S1Q8NGN2 331 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ST7LQ8TDW4 575 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL9Q9P2J3 617 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNG2Q9UJ96 466 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CUL9Q8IWT3 2517 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 H0Y8X5 98 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCD4O14678 606 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HRGP04196 525 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GP1BAP07359 652 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GLULP15104 373 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ALG11Q2TAA5 492 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IDNKQ5T6J7 187 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF441Q8N8Z8 693 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF511Q8NB15 262 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6K3Q8NGY3 331 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LPAR4Q99677 370 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LHX6Q9UPM6 363 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DUXAA6NLW8 204 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 H0YIZ8 118 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DBIP07108 87 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 COL9A1P20849 921 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN12P56749 244 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS7P62081 194 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MESTQ5EB52 335 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM61Q5EBN2 209 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 BICRALQ6AI39 1079 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NMNAT3Q96T66 252 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PBX4Q9BYU1 374 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TOR1AO14656 332 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LIPNQ5VXI9 398 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIQKQ629K1 86 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEFF1Q8IYR6 380 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS35Q8N3Z0 413 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SGTBQ96EQ0 304 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR26Q9H7D7 661 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CLCA2Q9UQC9 943 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DAPL1A0PJW8 107 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SRMP19623 302 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1024LP59773 190 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TFF2Q03403 129 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SPEM2Q0P670 501 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OPCMLQ14982 345 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGEF6Q15052 776 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 POU4F3Q15319 338 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CORO6Q6QEF8 472 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms