RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ANGPT1Q15389 498 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM16LQ309B1 348 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TP53I3Q53FA7 332 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 VASNQ6EMK4 673 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 DCDC5Q6ZRR9 648 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GRINAQ7Z429 371 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ADGRG3Q86Y34 549 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PARP16Q8N5Y8 322 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NEIL3Q8TAT5 605 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 DDOQ99489 341 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NPAS1Q99742 590 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 JAM3Q9BX67 310 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 C12orf10Q9HB07 376 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SMURF1Q9HCE7 757 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 POLE4Q9NR33 117 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 INPP5EQ9NRR6 644 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MYOTQ9UBF9 498 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM72A0PK05 275 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MEGF11A6BM72 1044 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 A8MVM7 634 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 C9J4A7 227 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMD9O00233 223 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TAF4O00268 1085 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGEF9O43307 516 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SULT1C4O75897 302 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR6A2O95222 327 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 BGLAPP02818 100 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CELA2AP08217 269 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CD40LGP29965 261 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GRPRP30550 384 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SDHAP31040 664 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 UQCRC1P31930 480 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CLDN6P56747 220 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTC1P68032 377 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTA1P68133 377 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 E2F1Q01094 437 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MC2RQ01718 297 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF45Q02386 682 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MADCAM1Q13477 382 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 DNASE1L3Q13609 305 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ARSKQ6UWY0 536 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM122BQ7Z309 247 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC35F2Q8IXU6 374 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 KDM8Q8N371 416 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC75AQ8NAA5 344 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GALNT6Q8NCL4 622 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10G3Q8NGC4 313 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5J2Q8NH18 312 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SNX33Q8WV41 574 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LIPHQ8WWY8 451 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM234Q8WY98 164 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A46Q96AG3 418 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 COX4I2Q96KJ9 171 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LRFN5Q96NI6 719 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CMKLR1Q99788 373 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ALG12Q9BV10 488 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC26A1Q9H2B4 701 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FKRPQ9H9S5 495 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF229Q9UJW7 825 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 R4GN57 208 aa3.6□□□□□ -1.83
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LRRTM4-201ENST00000409088 ADAMTS20P59510 1910 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A075B6Q4 140 aa3.6□□□□□ -1.83
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LRRTM4-201ENST00000409088 TVP23AA6NH52 213 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 B4DXG7 233 aa3.6□□□□□ -1.83
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LRRTM4-201ENST00000409088 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.6□□□□□ -1.83
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LRRTM4-201ENST00000409088 ADAM10O14672 748 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NCR1O76036 304 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GLCEO94923 617 aa3.6□□□□□ -1.83
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LRRTM4-201ENST00000409088 AHSA1O95433 338 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 IGF2P01344 180 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2T7P0C7T2 308 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CCKBRP32239 447 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 KIF26BQ2KJY2 2108 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ISXQ2M1V0 245 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM69AQ5T7M9 428 aa3.6□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 C1orf140Q5VVS0 124 aa3.6□□□□□ -1.83
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