RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 DDOQ99489 341 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ISYNA1Q9NPH2 558 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PPH5 198 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM82A0PJX8 343 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 F5H5K5 113 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 H7C1Q1 480 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SURF4O15260 269 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV3-25P01717 112 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 APOA2P02652 100 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR8G3PP0DMU2 310 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 GLB1P16278 677 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 S100A11P31949 105 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TSPAN31Q12999 210 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR4M1Q8NGD0 313 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 RNF32Q9H0A6 362 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ITGB2P05107 769 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TACR3P29371 465 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC7A9P82251 487 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ILKQ13418 452 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 KIR2DS3Q14952 304 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 COX20Q5RI15 118 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR52W1Q6IF63 320 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PBX4Q9BYU1 374 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 METTL9Q9H1A3 318 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LHX6Q9UPM6 363 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SULT1C4O75897 302 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 UBL3O95164 117 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 HLA-DOBP13765 273 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SRP9P49458 86 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CST6Q15828 149 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PLPP5Q8NEB5 264 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR13C2Q8NGS9 318 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR5B2Q96R09 309 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 RGS11O94810 467 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CBX7O95931 251 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 C1QBP02746 253 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 KLKB1P03952 638 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TBPP20226 339 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ETV1P50549 477 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CLDN6P56747 220 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM207Q6UWW9 146 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC43A2Q8N370 569 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ABHD4Q8TB40 342 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SORCS2Q96PQ0 1159 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SOCS6O14544 535 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 AKR7A2O43488 359 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 NME2P22392 152 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 NFYBP25208 207 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 RPS18P62269 152 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ACVR1Q04771 509 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 AKR1C1Q04828 323 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SRYQ05066 204 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 AQP6Q13520 282 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CST9LP1Q5W188 147 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR7E24Q6IFN5 339 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 GAREM2Q75VX8 874 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 KDM8Q8N371 416 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OR56B1Q8NGI3 324 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 NAT6Q93015 286 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 MIB2Q96AX9 1013 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 NEURL2Q9BR09 285 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PRR14Q9BWN1 585 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms