RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 SEM1Q6ZVN7 128 aa25.14■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 LRRC75AQ8NAA5 344 aa25.14■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 MYO7BQ6PIF6 2116 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 CD8B2A6NJW9 211 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF716A6NP11 495 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 RCBTB2O95199 551 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 FCGR2AP12318 317 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 RPL4P36578 427 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 PRPS1P60891 318 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 ZP4Q12836 540 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 SLC17A1Q14916 467 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 ANKDD1AQ495B1 522 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 PARP8Q8N3A8 854 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 OR9K2Q8NGE7 335 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 OXGR1Q96P68 337 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 RIBC2Q9H4K1 309 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 CALHM2Q9HA72 323 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 INIPQ9NRY2 104 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 ORC6Q9Y5N6 252 aa25.13■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 RFX4Q33E94 735 aa25.12■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa25.12■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 GCNT2Q8N0V5 402 aa25.12■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 IQCF1Q8N6M8 205 aa25.12■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 CLDN22Q8N7P3 220 aa25.12■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 WNT2BQ93097 391 aa25.12■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 RNF122Q9H9V4 155 aa25.12■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 IL20Q9NYY1 176 aa25.12■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 PCNX1Q96RV3 2341 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 PPP1R3DO95685 299 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 EPHA2P29317 976 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 UQCRFS1P47985 274 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 CTXN1P60606 82 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 ERVK-25P63136 954 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 C1DQ13901 141 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 UEVLDQ8IX04 471 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 MCEMP1Q8IX19 187 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 SLC43A2Q8N370 569 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 PACRGLQ8N7B6 248 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 ANKK1Q8NFD2 765 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 OR52L1Q8NGH7 329 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 TEX47Q8TBZ9 253 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 MBOAT4Q96T53 435 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 KATNB1Q9BVA0 655 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 TSSK6Q9BXA6 273 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF462Q96JM2 2506 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 FREM1Q5H8C1 2179 aa25.11■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 DLGAP1O14490 977 aa25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 VAMP5O95183 116 aa25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 SNAP29O95721 258 aa25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 SLC6A6P31641 620 aa25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 MELKQ14680 651 aa25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 SNCBQ16143 134 aa25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 PXKQ7Z7A4 578 aa25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 GALNT11Q8NCW6 608 aa25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 IFT27Q9BW83 186 aa25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 TOR3AQ9H497 397 aa25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 FANCFQ9NPI8 374 aa25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 MED29Q9NX70 200 aa25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 KLHL9Q9P2J3 617 aa25.1■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF43P17038 809 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 GNLYP22749 145 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 CA7P43166 264 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 SLC16A1P53985 500 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 CRISP1P54107 249 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 RAD23AP54725 363 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 CASP6P55212 293 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 POU4F3Q15319 338 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 TAF11Q15544 211 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 TUSC5Q8IXB3 177 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 MARVELD2Q8N4S9 558 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 OR4Q3Q8NH05 313 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 TTYH2Q9BSA4 534 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 GABARAPL3Q9BY60 117 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 NDEL1Q9GZM8 345 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 C8orf4Q9NR00 106 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 NOX1Q9Y5S8 564 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa25.09■■□□□ 1.61
GIPC1-202ENST00000393028 TOXO94900 526 aa25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms