RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

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Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.48□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.48□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 NAV3Q8IVL0 2385 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 DPRXA6NFQ7 191 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF726A6NNF4 738 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 MS4A18H0YCH9 400 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 PLPP3O14495 311 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 DYNC1I1O14576 645 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 GSTA4O15217 222 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 CLOCKO15516 846 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 SNX3O60493 162 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 GMNNO75496 209 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 CD99P14209 185 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 MNAT1P51948 309 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 SEC24CP53992 1094 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 IL1RL1Q01638 556 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 LIPEQ05469 1076 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 BSPH1Q075Z2 132 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 PUDPQ08623 228 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 ZP4Q12836 540 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 NIPAL3Q6P499 406 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKRD16Q6P6B7 361 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5J2Q8NH18 312 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 GSX2Q9BZM3 304 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 NANSQ9NR45 359 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 NDE1Q9NXR1 346 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF229Q9UJW7 825 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 AKAP9Q99996 3911 aa7.47□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
MT-TS1-201ENST00000387416 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 VSTM5A8MXK1 200 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 MGRN1O60291 552 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 DCTN3O75935 186 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 LYPD3O95274 346 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 ADORA3P0DMS8 318 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 BMP4P12644 408 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 DRD4P21917 467 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 CD40P25942 277 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 SELENOPP49908 381 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 CRYBA2P53672 197 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 TAS2R41P59536 307 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 ADAM8P78325 824 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 ST3GAL3Q11203 375 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 ETFDHQ16134 617 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF74Q16587 644 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 SPATS1Q496A3 300 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 AGAP6Q5VW22 663 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 TREML1Q86YW5 311 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 WDR31Q8NA23 367 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 OR52N5Q8NH56 324 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 LIPHQ8WWY8 451 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 WFDC6Q9BQY6 131 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 ALG2Q9H553 416 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 CMTM6Q9NX76 183 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.46□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 CENPBD1B2RD01 187 aa7.45□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 CXCR6O00574 342 aa7.45□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 ABCD4O14678 606 aa7.45□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 CH25HO95992 272 aa7.45□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 PLAUP00749 431 aa7.45□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 MT-ND1P03886 318 aa7.45□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 IFNW1P05000 195 aa7.45□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 DANCRP0C864 163 aa7.45□□□□□ -1.22
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