RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 HPCAL1P37235 193 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDKN2CP42773 168 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 GIPRP48546 466 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM33P57088 247 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL13RA1P78552 427 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 CAV1Q03135 178 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 OCLNQ16625 522 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 COX20Q5RI15 118 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 C11orf87Q6NUJ2 197 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 NHLRC1Q6VVB1 395 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 C16orf62Q7Z3J2 963 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 VRK2Q86Y07 508 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC22A9Q8IVM8 553 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 C10orf107Q8IVU9 208 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 DDIASQ8IXT1 998 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM169BQ8N8A8 192 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 XAGE5Q8WWM1 108 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 DDIT4LQ96D03 193 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTERF3Q96E29 417 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 TXNDC15Q96J42 360 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR2M2Q96R28 347 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 DUSP26Q9BV47 211 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 MECRQ9BV79 373 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC00470Q9BZP3 86 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB17Q9H0T7 212 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLITRK2Q9H156 845 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 MARCH7Q9H992 704 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 HHATLQ9HCP6 504 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC52A3Q9NQ40 469 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 OXSMQ9NWU1 459 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBAP1Q9NZ09 502 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAAR3PQ9P1P4 343 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBK1Q9UHD2 729 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 DUSP13Q9UII6 198 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 MID2Q9UJV3 735 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCDHGB4Q9UN71 923 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 LYSTQ99698 3801 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 TENM2Q9NT68 2774 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRAV40A0A0B4J280 105 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 LOC100653049A0A140TA62 436 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ISPDA4D126 451 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 C17orf100A8MU93 164 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRN3E7EW58 273 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 J3QLI3 93 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 M0R082 166 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRT34O76011 436 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPIP06744 558 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 GSTA1P08263 222 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR8G3PP0DMU2 310 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 CD80P33681 288 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARR3P36575 388 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 MPV17P39210 176 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 CRYBB2P43320 205 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPS5P46782 204 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 EVX1P49640 407 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLK1P49759 484 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAG2P55895 527 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF154Q13106 437 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEFB112Q30KQ8 113 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 PGS1Q32NB8 556 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM153CQ494X1 144 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPAT3Q53EU6 434 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBLN7Q53RD9 439 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARMCX4Q5H9R4 360 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 C6orf136Q5SQH8 315 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATA46Q5T0L3 261 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 C1orf140Q5VVS0 124 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL23RQ5VWK5 629 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 SAXO2Q658L1 398 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATG16L1Q676U5 607 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM225Q6GV28 225 aa4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms