RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMCO1Q9UM00 188 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF835Q9Y2P0 537 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRSS37A4D1T9 235 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 LRP5LA4QPB2 252 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 COLCA2A8K830 154 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 A8MUI8 341 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRKAB2O43741 272 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 UPK3AO75631 287 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 MBD3O95983 291 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 AK1P00568 194 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 DCNP07585 359 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 RHOXF2BP0C7M4 288 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 PNMTP11086 282 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 GPM6AP51674 278 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 HTD2P86397 168 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 IL1RL1Q01638 556 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 KLRB1Q12918 225 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 SELPLGQ14242 412 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGFBP7Q16270 282 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 DPYSL2Q16555 572 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 TTLL9Q3SXZ7 439 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 COX19Q49B96 90 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 GGTA1PQ4G0N0 100 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 CARD16Q5EG05 197 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 NCR3LG1Q68D85 454 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 PYHIN1Q6K0P9 492 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF880Q6PDB4 577 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 PGAP1Q75T13 922 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF573Q86YE8 665 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF683Q8IZ20 524 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF709Q8N972 641 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 FNDC5Q8NAU1 212 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 UFD1Q92890 307 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 FGF11Q92914 225 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 PELI1Q96FA3 418 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 CMTM7Q96FZ5 175 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 BMFQ96LC9 184 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 TGM7Q96PF1 710 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR2A5Q96R48 311 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCT7Q99832 543 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 GBA3Q9H227 469 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 CLMPQ9H6B4 373 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 NOX3Q9HBY0 568 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC40A1Q9NP59 571 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 SIRT7Q9NRC8 400 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 EXD2Q9NVH0 621 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 GIN1Q9NXP7 522 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 TAS2R3Q9NYW6 316 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 SEC14L3Q9UDX4 400 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 ODF2LQ9ULJ1 636 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 RFNGQ9Y644 331 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 PTPRTO14522 1441 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 CD5LO43866 347 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 TBX19O60806 448 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 SCGNO76038 276 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 VAMP5O95183 116 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 FGF1P05230 155 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 CSF3P09919 207 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 GKN3PP0CG01 181 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 HSMCR30P0CW71 290 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF30P17039 623 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 PGAM1P18669 254 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 GCAP28676 217 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 GDI1P31150 447 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 CA8P35219 290 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 CASP4P49662 377 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 NUCB2P80303 420 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 C1orf61Q13536 156 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 OXA1LQ15070 435 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 STK11Q15831 433 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 GUCA2BQ16661 112 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC36A3Q495N2 470 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRR9Q5T870 116 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 FBXW9Q5XUX1 488 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM225Q6GV28 225 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC25A34Q6PIV7 304 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM92BQ6ZTR7 304 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 UTS2BQ765I0 119 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-407P-201ENST00000365280 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms