RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A53Q5H9E4 307 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 CDC6Q99741 560 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ALG12Q9BV10 488 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 BARHL1Q9BZE3 327 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 CPNE5Q9HCH3 593 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 FTCDNL1E5RQL4 147 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 J3QLW9 94 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 GAAP10253 952 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF19P17023 458 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 CLDN6P56747 220 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ACTA2P62736 377 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ACTG2P63267 376 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 OPN5Q6U736 354 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 RFLNBQ8N5W9 214 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 FNDC8Q8TC99 324 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A46Q96AG3 418 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 GALNT8Q9NY28 637 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 C11orf98E9PRG8 122 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 GABRPO00591 440 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF208O43345 1280 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 SELENOFO60613 162 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 RAB40ALP0C0E4 278 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 CD53P19397 219 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 PYCR1P32322 319 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 OR12D2P58182 307 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 TUBA3EQ6PEY2 450 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 SYS1Q8N2H4 156 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 CT55Q8WUE5 264 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 MRGPRX4Q96LA9 322 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF160Q9HCG1 818 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 TCFL5Q9UL49 500 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 RENP00797 406 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 HCCSP53701 268 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 OR2M3Q8NG83 312 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 E9PI62 339 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 TAF4O00268 1085 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 PLPP3O14495 311 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 MAP2K6P52564 334 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 SNTA1Q13424 505 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 PLPPR5Q32ZL2 321 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 SLC6A19Q695T7 634 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 MARCH9Q86YJ5 346 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 SYT14Q8NB59 555 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 OR2T4Q8NH00 348 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF417Q8TAU3 575 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 KCNS3Q9BQ31 491 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 HDHD5Q9BXW7 423 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 SPRY4Q9C004 299 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 SMURF1Q9HCE7 757 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 POLHQ9Y253 713 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-201ENST00000313173 OR6A2O95222 327 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 TCN2P20062 427 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 TGM1P22735 817 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 SDC2P34741 201 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 HSF2Q03933 536 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 MXD1Q05195 221 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 MFSD13AQ14CX5 517 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 CDONQ4KMG0 1287 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM81Q6P7N7 255 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 MFSD8Q8NHS3 518 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 DDIT4LQ96D03 193 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 TSSK2Q96PF2 358 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 H7C1C5 153 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 PLPP2O43688 288 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 IGHMP01871 453 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 AHCYP23526 432 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 RPL27P61353 136 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 RPS18P62269 152 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 LCN6P62502 163 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 RUNX1T1Q06455 604 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 ASB15Q8WXK1 588 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 CUL9Q8IWT3 2517 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 FAM171A2A8MVW0 826 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 C9orf172C9J069 976 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 LRP3O75074 770 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 CLEC2LP0C7M8 214 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 CD40LGP29965 261 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 PPP5CP53041 499 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 ACKR1Q16570 336 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 TP53I3Q53FA7 332 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 ARL9Q6T311 187 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 LYPD4Q6UWN0 246 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 IL20RBQ6UXL0 311 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM91Q6ZNR0 172 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 FADS6Q8N9I5 356 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF519Q8TB69 540 aa24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms