RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 FAM27E3Q08E93 113 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 PDK3Q15120 406 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 TSC22D1Q15714 1073 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 TFAP2EQ6VUC0 442 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 HS3ST5Q8IZT8 346 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 SCAIQ8N9R8 606 aa8.05□□□□□ -1.12
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PDE4D-201ENST00000309641 OR9Q2Q8NGE9 314 aa8.05□□□□□ -1.12
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PDE4D-201ENST00000309641 ASPNQ9BXN1 380 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 GLRX2Q9NS18 164 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 GALNT8Q9NY28 637 aa8.05□□□□□ -1.12
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PDE4D-201ENST00000309641 PROCRQ9UNN8 238 aa8.05□□□□□ -1.12
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PDE4D-201ENST00000309641 PRSS44E7EML9 344 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 TNFRSF11BO00300 401 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 MSTNO14793 375 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 CIB2O75838 187 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 CD8BP10966 210 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF43P17038 809 aa8.05□□□□□ -1.12
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PDE4D-201ENST00000309641 CLDN17P56750 224 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 FXYD6P3P58550 94 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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PDE4D-201ENST00000309641 MFSD13AQ14CX5 517 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 CASP12Q6UXS9 341 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 RRM2BQ7LG56 351 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
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PDE4D-201ENST00000309641 NTN4Q9HB63 628 aa8.05□□□□□ -1.12
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PDE4D-201ENST00000309641 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 RASD1Q9Y272 281 aa8.05□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
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PDE4D-201ENST00000309641 POU2F1P14859 743 aa8.04□□□□□ -1.12
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PDE4D-201ENST00000309641 OR3A2P47893 321 aa8.04□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 ASCL1P50553 236 aa8.04□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 ACTR3P61158 418 aa8.04□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
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PDE4D-201ENST00000309641 POU4F3Q15319 338 aa8.04□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.04□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.04□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 OAFQ86UD1 273 aa8.04□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa8.04□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 MCCC2Q9HCC0 563 aa8.04□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 EMC3Q9P0I2 261 aa8.04□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
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PDE4D-201ENST00000309641 RNF13O43567 381 aa8.03□□□□□ -1.12
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PDE4D-201ENST00000309641 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
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PDE4D-201ENST00000309641 GASTP01350 101 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 HIST1H2ABP04908 130 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 IFNGR1P15260 489 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 PRKACGP22612 351 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 SMIM11AP58511 58 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 RUNX1T1Q06455 604 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 C1DQ13901 141 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 CARD17Q5XLA6 110 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-201ENST00000309641 NIPAL3Q6P499 406 aa8.03□□□□□ -1.12
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