RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 Q96M85 177 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 TRIM2Q9C040 744 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ADGRL4Q9HBW9 690 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 GPR34Q9UPC5 381 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 OR5K3A6NET4 321 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 CD3DP04234 171 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SPARCP09486 303 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ZNF28P17035 718 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 FGL1Q08830 312 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 INPP5EQ9NRR6 644 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SMCO1Q147U7 214 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SFXN5Q8TD22 340 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 HRH4Q9H3N8 390 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 FANCFQ9NPI8 374 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SCN8AQ9UQD0 1980 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 CD2P06729 351 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 OR2T7P0C7T2 308 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 S100A10P60903 97 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 OR7A5Q15622 319 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 OR2T27Q8NH04 317 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SPACA7Q96KW9 195 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SOSTQ9BQB4 213 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 LHX9Q9NQ69 397 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 PRSS16Q9NQE7 514 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 GREM1O60565 184 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 AKAIN1P0CW23 69 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 PPM1AP35813 382 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 LSSP48449 732 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 GAS1P54826 345 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ERV3-1Q14264 604 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 TAS2R5Q9NYW4 299 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 A0A0A6YYD5 115 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 FITM1A5D6W6 292 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 PRRT4C9JH25 899 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 MCIDASD6RGH6 385 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 GPR31O00270 319 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 LIPNQ5VXI9 398 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 OR10K2Q6IF99 312 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 HGDQ93099 445 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ZNF75AQ96N20 296 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.06□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 VWA8A3KMH1 1905 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 TMEM82A0PJX8 343 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 BDH1Q02338 343 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 MESP2Q0VG99 397 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 OR2L3Q8NG85 312 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ALG12Q9BV10 488 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 POFUT1Q9H488 388 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 CREBZFQ9NS37 354 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 A0A0B4J2A0 478 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 KCNAB3O43448 404 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SGCEO43556 437 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 TPPPO94811 219 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ZFPL1O95159 310 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 WDR34Q96EX3 536 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ARHGDIGQ99819 225 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SIGLEC7Q9Y286 467 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 AIPO00170 330 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 CTNSO60931 367 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 HTR2AP28223 471 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 THBS2P35442 1172 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 CXADRP78310 365 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ETFDHQ16134 617 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 BVESQ8NE79 360 aa14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms