RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6S1Q8NH40 331 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC39A7Q92504 469 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 MND1Q9BWT6 205 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ASB6Q9NWX5 421 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 IRGMA1A4Y4 181 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 C11orf98E9PRG8 122 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 PEX14O75381 377 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 OPN1LWP04000 364 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 GSTT2P0CG29 244 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 GSTT2BP0CG30 244 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 CYB561P49447 251 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP2K6P52564 334 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 VASH2Q86V25 355 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 P2RY8Q86VZ1 359 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ATCAYQ86WG3 371 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 OR51L1Q8NGJ5 315 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 OR1J4Q8NGS1 313 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 MFSD8Q8NHS3 518 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TM9SF4Q92544 642 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 JAM3Q9BX67 310 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ADGRL4Q9HBW9 690 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 HAO2Q9NYQ3 351 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM129A0AVI4 362 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 MS4A18H0YCH9 400 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 FZD7O75084 574 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINI2O75830 405 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SNX4O95219 450 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 HLA-DOBP13765 273 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 PAICSP22234 425 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ADH6P28332 368 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 CD96P40200 585 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 MYBPHQ13203 477 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SPCS2Q15005 226 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 OR7A5Q15622 319 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 MS4A18Q3C1V0 323 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SPINK14Q6IE38 97 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 KDM8Q8N371 416 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 EXD3Q8N9H8 876 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 DDIT4LQ96D03 193 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 IP6K3Q96PC2 410 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 POTEKPQ9BYX7 375 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 LIPT2A6NK58 231 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 NEURL1O76050 574 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SCG5P05408 212 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 LIPCP11150 499 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 MYL12AP19105 171 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ITGA3P26006 1051 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 DPP4P27487 766 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TGFBR1P36897 503 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC16A1P53985 500 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 LEG1Q6P5S2 330 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM99Q8N816 258 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TSSK2Q96PF2 358 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 NDEL1Q9GZM8 345 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 PINLYPA6NC86 204 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 DCTN6O00399 190 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 MYL12BO14950 172 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 P04436 131 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SBK2P0C263 348 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SPI1P17947 270 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 AHCYP23526 432 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 GADD45AP24522 165 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 IDUAP35475 653 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF1P41567 113 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 NFATC3Q12968 1075 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms