RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272163.8

LBR-201, Transcript of lamin B receptor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LBR, Length 3,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBR-201ENST00000272163 CYBRD1Q53TN4 286 aa7.3□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 RABL3Q5HYI8 236 aa7.3□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.3□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.3□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 BEX2Q9BXY8 128 aa7.3□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.3□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.3□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 DECR2Q9NUI1 292 aa7.3□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.3□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.3□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 CXCR6O00574 342 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 FAM107AO95990 144 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 POU1F1P28069 291 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 ATP6V1E1P36543 226 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 OR1E2P47887 323 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 TUBA1BP68363 451 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 TUBA4AP68366 448 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 PHC1P78364 1004 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 RNF220Q5VTB9 566 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 NANOGP8Q6NSW7 305 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 TFAP2EQ6VUC0 442 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 TUBA1AQ71U36 451 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 NINJ1Q92982 152 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 C18orf12Q96KH6 178 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 KCNK17Q96T54 332 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 SEPHS2Q99611 448 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 SH3GL2Q99962 352 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 SLC19A3Q9BZV2 496 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 PLK3Q9H4B4 646 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 SLC35F4A4IF30 521 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 PSMG1O95456 288 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 NPPAP01160 153 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 HRGP04196 525 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 KRTAP10-9P60411 292 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 PCBD1P61457 104 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 DAG1Q14118 895 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 CDSNQ15517 529 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 ZNF613Q6PF04 617 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 SPATA24Q86W54 205 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 OR4F15Q8NGB8 312 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 POC1BQ8TC44 478 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 B2RBV5 119 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 PRG2P13727 222 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 KDELR2P33947 212 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 ALG10Q5BKT4 473 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 GLYATQ6IB77 296 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 KRT80Q6KB66 452 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 ZNF611Q8N823 705 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 PSD2Q9BQI7 771 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.29□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 LIPT2A6NK58 231 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 TNFSF13O75888 250 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 ARR3P36575 388 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 RAD52P43351 418 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 GIPRP48546 466 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 SLC9A3P48764 834 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 PDLIM4P50479 330 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 GAS1P54826 345 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 OR8J3Q8NGG0 315 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 TMEM239Q8WW34 195 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 PRR14Q9BWN1 585 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 MED29Q9NX70 200 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 A6NIZ1 184 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 H3BN98 237 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 OR8G3PP0DMU2 310 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 PCGF2P35227 344 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 SEC24CP53992 1094 aa7.28□□□□□ -1.24
LBR-201ENST00000272163 RAP1BP61224 184 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms