RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 TPK1Q9H3S4 243 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCB9Q9NP78 766 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CMC2Q9NRP2 79 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HCFC1P51610 2035 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 DAPL1A0PJW8 107 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HMX3A6NHT5 357 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 H0YGG7 62 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM229AH3BQW9 127 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GABRPO00591 440 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF9O43307 516 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FRS3O43559 492 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CHP2O43745 196 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM127O75204 238 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 NKX2-2O95096 273 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 LIMS3P0CW19 117 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 LIMS4P0CW20 117 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RNH1P13489 461 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CELP19835 753 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FUT4P22083 530 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RORAP35398 523 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR143P51810 404 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GAS1P54826 345 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CTBP2P56545 445 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SELENBP1Q13228 472 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RIN1Q13671 783 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RUNX2Q13950 521 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GALEQ14376 348 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 LCE3BQ5TA77 95 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 BICRALQ6AI39 1079 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FCRL6Q6DN72 434 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RTL4Q6ZR62 310 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 COMTD1Q86VU5 262 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CPOQ8IVL8 374 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 LAX1Q8IWV1 398 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM203Q969S6 136 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FRMD6Q96NE9 622 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 IFT27Q9BW83 186 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 UBQLN3Q9H347 655 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 UCK1Q9HA47 277 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 QPCTLQ9NXS2 382 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CBLCQ9ULV8 474 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 V9GYH0 126 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.4□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.4□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 STAB1Q9NY15 2570 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 COL6A5A8TX70 2615 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PQ09 198 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CDHR4A6H8M9 788 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM172BPA6NC97 362 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CENPXA8MT69 81 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.39□□□□□ -1.39
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