RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000200181.7

ITGB4-201, Transcript of integrin subunit beta 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGB4, Length 5,919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4-201ENST00000200181 ABHD4Q8TB40 342 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 FAM3CQ92520 227 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 GHSRQ92847 366 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ABOP16442 354 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SLC5A2P31639 672 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 VHLLQ6RSH7 139 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 DPPA2Q7Z7J5 298 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CLDN22Q8N7P3 220 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ST8SIA2Q92186 375 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 REEP6Q96HR9 211 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SLC6A18Q96N87 628 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 BMP1P13497 986 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 LRRC15Q8TF66 581 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 NECTIN4Q96NY8 510 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ABHD6Q9BV23 337 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ETV7Q9Y603 341 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 M0QYG6 137 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 DAPP51397 102 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ERVFC1P60507 584 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 OVCH1Q7RTY7 1134 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 OR5D18Q8NGL1 313 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 OR10R2Q8NGX6 335 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ZP2Q05996 745 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SLC35G3Q8N808 338 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SCARB1Q8WTV0 552 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ZNF264O43296 627 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CSF2RAP15509 400 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CR2P20023 1033 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ECI1P42126 302 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 FXNQ16595 210 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 C1orf220Q5T0J3 134 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CATSPERDQ86XM0 798 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 RHBDD1Q8TEB9 315 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 WDR76Q9H967 626 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 HSD17B6O14756 317 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PMS2P2O95744 297 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CD63P08962 238 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CTRB1P17538 263 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 GABRA4P48169 554 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 GRB2P62993 217 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 HBA1P69905 142 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CTRB2Q6GPI1 263 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SLC22A24Q8N4F4 322 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 BTBD17A6NE02 478 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 UNCXA6NJT0 531 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 C1orf105O95561 183 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 GPR75O95800 540 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 HPNP05981 417 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 OPN5Q6U736 354 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 TMUB2Q71RG4 321 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 OR2T11Q8NH01 316 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 NECAP2Q9NVZ3 263 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 LHX6Q9UPM6 363 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 XRCC3O43542 346 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 ACKR3P25106 362 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 OR1D4P47884 311 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SLC5A12Q1EHB4 618 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 MARCH8Q5T0T0 291 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PIANPQ8IYJ0 282 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CYTIPO60759 359 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CSO75390 466 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 IQCF3P0C7M6 154 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CCR6P51684 374 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CLDN2P57739 230 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 TMEM106AQ96A25 262 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 DTD2Q96FN9 168 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 MED30Q96HR3 178 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 SLC22A11Q9NSA0 550 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 OR52A1Q9UKL2 312 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 DFFBO76075 338 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PSMB5P28074 263 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 RAB33AQ14088 237 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CGB2Q6NT52 195 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 OPA3Q9H6K4 179 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 EMCNQ9ULC0 261 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 KLK4Q9Y5K2 254 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CBY3A6NI87 242 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CCR7P32248 378 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 DUSP6Q16828 381 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGB4-201ENST00000200181 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms