RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 RYKP34925 604 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT20P35900 424 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 LAPTM4AQ15012 233 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ENTPD8Q5MY95 495 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD34AQ69YU3 496 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT80Q6KB66 452 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 P3H2Q8IVL5 708 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 OR14L1PQ8NHC6 308 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 STARD4Q96DR4 205 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM2Q9C040 744 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 RHCGQ9UBD6 479 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 STAB1Q9NY15 2570 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAPPC13A5PLN9 417 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 MSTNO14793 375 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFAIP8O95379 198 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ESRRGP62508 458 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 NPRL3Q12980 569 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 FGD3Q5JSP0 725 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf94Q6P1W5 598 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 VWA1Q6PCB0 445 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PODNL1Q6PEZ8 512 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 C22orf34Q6ZV56 151 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM71CQ8NEG0 241 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 IGFBPL1Q8WX77 278 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 HS3ST6Q96QI5 342 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PITX2Q99697 317 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PIGQQ9BRB3 760 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF696Q9H7X3 374 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R10Q9NYW0 307 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 NDRG3Q9UGV2 375 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6C70A6NIJ9 312 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CASKO14936 926 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ZIC3O60481 467 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 UTS2O95399 124 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 GASTP01350 101 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CHMP24386 653 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 SRD5A2P31213 254 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 B3GALT5-AS1P59052 145 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PLAURQ03405 335 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PLCXD2Q0VAA5 305 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 THAP5Q7Z6K1 395 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PLCZ1Q86YW0 608 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 SETD9Q8NE22 299 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PIGTQ969N2 578 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC41A3Q96GZ6 507 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM27Q9HBJ8 222 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 BATF3Q9NR55 127 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 KLRF1Q9NZS2 232 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 DSCAMO60469 2012 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CUBNO60494 3623 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 C17orf51A8MQB3 221 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 NPIPA7E9PJI5 369 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BNH8 94 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 SCDO00767 359 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 MITFO75030 526 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 REM1O75628 298 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 GNAO1P09471 354 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 NPIPA8P0DM63 369 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CRYGSP22914 178 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 RFX3P48380 749 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN15P56746 228 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 EFR3AQ14156 821 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC23BQ15437 767 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ACKR1Q16570 336 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 AQP11Q8NBQ7 271 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 HRASLS5Q96KN8 279 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 MUS81Q96NY9 551 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 HEATR5AQ86XA9 2040 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087WUU8 490 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ALG1L2C9J202 215 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 INAFM1C9JVW0 142 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 FRS3O43559 492 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10H3O60404 316 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CSTAP01040 98 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 HPGDP15428 266 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTM3P21266 225 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 FUT4P22083 530 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 GAS1P54826 345 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 BLMHQ13867 455 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1Q1Q15612 314 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF691Q5VV52 312 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PGBD2Q6P3X8 592 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 BTLAQ7Z6A9 289 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4K5Q8NGD3 323 aa21.53■■□□□ 1.04
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