RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 RAC1P63000 192 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF91Q05481 1191 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ZP4Q12836 540 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGADQ13349 1161 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF766Q5HY98 468 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS48Q7RTY5 328 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 MYDGFQ969H8 173 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TTTY12Q9BZ98 90 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAPPC4Q9Y296 219 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PNR3 127 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 DPPA5A6NC42 116 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 SNTNA6NMZ2 147 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAPPC6AO75865 159 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 GLSO94925 669 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6A2O95222 327 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 HPNP05981 417 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK1P06493 297 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 MEOX1P50221 254 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 CRMP1Q14194 572 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 HYAL4Q2M3T9 481 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PLBD1Q6P4A8 553 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC81Q6ZN84 652 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD8Q6ZWB6 473 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 SPACA3Q8IXA5 215 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52E2Q8NGJ4 325 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PTP4A1Q93096 173 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 RFKQ969G6 155 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 Q96M85 177 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC90BQ9GZT6 254 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 CHST11Q9NPF2 352 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX5Q9Y5X3 404 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 A6NHS1 94 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf98E9PRG8 122 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 MS4A18H0YCH9 400 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF13O43567 381 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 MT-ND2P03891 347 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 SDHAP31040 664 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ALDH3B2P48448 385 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 MS4A18Q3C1V0 323 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM178AQ8NBL3 297 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC37A3Q8NCC5 494 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 BBS1Q8NFJ9 593 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4K13Q8NH42 304 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 MIB2Q96AX9 1013 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 RASD2Q96D21 266 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN32Q96QS1 320 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 DDOQ99489 341 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 INIPQ9NRY2 104 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 CSAG2Q9Y5P2 127 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PMS2P2O95744 297 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 AHCYP23526 432 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 RFC3P40938 356 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH11P55287 796 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ST3GAL4Q11206 333 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 EMC4Q5J8M3 183 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TMPPEQ6ZT21 453 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 GID4Q8IVV7 300 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 SDR9C7Q8NEX9 313 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 HCAR1Q9BXC0 346 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 MED20Q9H944 212 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 FANCFQ9NPI8 374 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 STSP08842 583 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PCMT1P22061 227 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 DIO1P49895 249 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2B6P58173 313 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 MVKQ03426 396 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TLE3Q04726 772 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PUDPQ08623 228 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR139Q6DWJ6 353 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 XAF1Q6GPH4 301 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 NIPAL3Q6P499 406 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 STX19Q8N4C7 294 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM251Q8N6I4 163 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 CYB561A3Q8NBI2 242 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 NPEPL1Q8NDH3 523 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 SFXN2Q96NB2 322 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 GRHPRQ9UBQ7 328 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 GJE1A6NN92 205 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 AKR7A3O95154 331 aa22.34■■□□□ 1.17
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