RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 DEF8Q6ZN54 512 aa23.73■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 TREML1Q86YW5 311 aa23.73■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 OR52N5Q8NH56 324 aa23.73■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 TPD52L3Q96J77 140 aa23.73■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 MPP4Q96JB8 637 aa23.73■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 CCL19Q99731 98 aa23.73■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 CMTM6Q9NX76 183 aa23.73■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 CD53P19397 219 aa23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 SLC7A2P52569 658 aa23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 TAS2R41P59536 307 aa23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 LIPEQ05469 1076 aa23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 PMS2P3Q13401 168 aa23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 CYBRD1Q53TN4 286 aa23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 NCMAPQ5T1S8 102 aa23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 KLHL17Q6TDP4 642 aa23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 EPHX4Q8IUS5 362 aa23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 UEVLDQ8IX04 471 aa23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 SLC15A3Q8IY34 581 aa23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 OR4D11Q8NGI4 311 aa23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 SEC14L4Q9UDX3 406 aa23.72■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 ZNF587BE7ETH6 402 aa23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 MT-ATP6P00846 226 aa23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 ITGA5P08648 1049 aa23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 PRDX6P30041 224 aa23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 IFNA8P32881 189 aa23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 SELENOPP49908 381 aa23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 GABRA6Q16445 453 aa23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 KLHL24Q6TFL4 600 aa23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 HACD2Q6Y1H2 254 aa23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 SCAIQ8N9R8 606 aa23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 SLC41A3Q96GZ6 507 aa23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 PCDHAC1Q9H158 963 aa23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 MYLK2Q9H1R3 596 aa23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 RCE1Q9Y256 329 aa23.71■■□□□ 1.39
BRD4-208ENST00000597315 SLC43A1O75387 559 aa23.7■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 OR6A2O95222 327 aa23.7■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 BGLAPP02818 100 aa23.7■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 CRYBA2P53672 197 aa23.7■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 BSPH1Q075Z2 132 aa23.7■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 C17orf78Q8N4C9 275 aa23.7■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 MUS81Q96NY9 551 aa23.7■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 CXXC4Q9H2H0 198 aa23.7■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 ALG2Q9H553 416 aa23.7■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 AMDHD2Q9Y303 409 aa23.7■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 SMPD2O60906 423 aa23.69■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 FZD7O75084 574 aa23.69■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 PLAUP00749 431 aa23.69■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 TNFRSF1BP20333 461 aa23.69■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 AHCYP23526 432 aa23.69■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 HMBOX1Q6NT76 420 aa23.69■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 LINC00114Q6XXX2 140 aa23.69■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa23.69■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 A0A1W2PR80 420 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 PDLIM1O00151 329 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 HS3ST1O14792 307 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 HIST1H2ABP04908 130 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 OR1E2P47887 323 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 SELENOWP63302 87 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 PUDPQ08623 228 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 TMEM108Q6UXF1 575 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 GPR137CQ8N3F9 429 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 OR5J2Q8NH18 312 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 HIST1H2ACQ93077 130 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 MOGAT1Q96PD6 335 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 TMEM204Q9BSN7 226 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 SLC19A3Q9BZV2 496 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 B3GAT1Q9P2W7 334 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 NOX1Q9Y5S8 564 aa23.68■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 CXCR6O00574 342 aa23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 NME4O00746 187 aa23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 CH25HO95992 272 aa23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 WNT11O96014 354 aa23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 UMPSP11172 480 aa23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 ZNF83P51522 516 aa23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 PSME3P61289 254 aa23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 PIK3C3Q8NEB9 887 aa23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 PIP5K1AQ99755 562 aa23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 LINC00470Q9BZP3 86 aa23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 NANSQ9NR45 359 aa23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 SLC17A5Q9NRA2 495 aa23.67■■□□□ 1.38
BRD4-208ENST00000597315 SLC25A15Q9Y619 301 aa23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms