RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591107.6

NPC1-212, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 3

Gene NPC1, Length 890 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-212	ENST00000591107	FXN	Q16595	210 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	GLYAT	Q6IB77	296 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	DHFR2	Q86XF0	187 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	HIPK4	Q8NE63	616 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	OR5W2	Q8NH69	310 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	SDF2	Q99470	211 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107		A0A096LNT2	108 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	CLDN24	A6NM45	220 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	C5orf58	C9J3I9	102 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107		E7EQL1	145 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	TMCC2	O75069	709 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	GMNN	O75496	209 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	UGT2B17	O75795	530 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	LY6H	O94772	140 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	TFPI	P10646	304 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	NTF4	P34130	210 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	RYK	P34925	604 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	NUDT6	P53370	316 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	SESN3	P58005	492 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	RAC3	P60763	192 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	CDK6	Q00534	326 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	FUT5	Q11128	374 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	CCNI	Q14094	377 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	SYPL1	Q16563	259 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	LCN8	Q6JVE9	175 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF525	Q8N782	197 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	FAM162A	Q96A26	154 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM19	Q96HH6	336 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ARL5B	Q96KC2	179 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	LRGUK	Q96M69	825 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	TRIM15	Q9C019	465 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	NGB	Q9NPG2	151 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NPC1-212	ENST00000591107	ANK2	Q01484	3957 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM247	A6NEH6	219 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	DUXA	A6NLW8	204 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107		M0R1B8	84 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	AGR2	O95994	175 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	CSTA	P01040	98 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	TFPT	P0C1Z6	253 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	NR2F1	P10589	423 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	ACTR3	P61158	418 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	MAPK11	Q15759	364 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	ETFDH	Q16134	617 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	GPAT3	Q53EU6	434 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	SYT14P1	Q58G82	188 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	DTX2	Q86UW9	622 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	SPATA24	Q86W54	205 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	CCDC103	Q8IW40	242 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	SLC43A2	Q8N370	569 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	ANKFN1	Q8N957	763 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	HHATL	Q9HCP6	504 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	EXD2	Q9NVH0	621 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	PLCE1	Q9P212	2302 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	OR5H1	A6NKK0	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF716	A6NP11	495 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	SULT2B1	O00204	365 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	AP3D1	O14617	1153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	ENTPD5	O75356	428 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NPC1-212	ENST00000591107	AQP1	P29972	269 aa		11.63	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.7 ms