RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608		Q9UF83	564 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	NUP50	Q9UKX7	468 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608		V9GY05	133 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	SNED1	Q8TER0	1413 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	CACNA1F	O60840	1977 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	INSR	P06213	1382 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	RAB29	O14966	203 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	TBL1X	O60907	577 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	THY1	P04216	161 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF24	P17028	368 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	NTS	P30990	170 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	RFC4	P35249	363 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC26A2	P50443	739 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	TGFBR3	Q03167	851 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	PRR4	Q16378	134 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	LPAL2	Q16609	132 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	PARP15	Q460N3	678 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	MARC1	Q5VT66	337 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	RNLS	Q5VYX0	342 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	C6orf223	Q8N319	242 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	FGGY	Q96C11	551 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	ATP5S	Q99766	215 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	GIN1	Q9NXP7	522 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	AHSP	Q9NZD4	102 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A0G2JLM5	398 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	RALB	P11234	206 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC2A5	P22732	501 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	IFNA8	P32881	189 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	RGR	P47804	291 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	IRF8	Q02556	426 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	ACVR1	Q04771	509 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	SELENBP1	Q13228	472 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	GNMT	Q14749	295 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF546	Q86UE3	836 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	NEIL2	Q969S2	332 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	HSFY1	Q96LI6	401 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	TSG101	Q99816	390 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	KIF25	Q9UIL4	384 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608		L7N2F9	121 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	OR2F2	O95006	317 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	FGG	P02679	453 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	POLR2M	P0CAP2	368 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	DCK	P27707	260 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	VHL	P40337	213 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	NSG1	P42857	185 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	MAGEA1	P43355	309 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	SELENOT	P62341	195 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	DOC2A	Q14183	400 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ATP9B-223	ENST00000590608	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82

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