RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC1A3	P43003	542 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	INPP1	P49441	399 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CENPA	P49450	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ETV1	P50549	477 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TPMT	P51580	245 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR143	P51810	404 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HSD17B7	P56937	341 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB38	P57729	211 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SHC2	P98077	582 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PITPNA	Q00169	270 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HSF2	Q03933	536 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HYAL1	Q12794	435 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	STX4	Q12846	297 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ASAH1	Q13510	395 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HTR4	Q13639	388 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RUNX2	Q13950	521 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM53B	Q14153	422 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ELOC	Q15369	112 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PGGHG	Q32M88	737 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	AMZ1	Q400G9	498 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DEFB134	Q4QY38	66 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TCTE1	Q5JU00	501 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ULK3	Q6PHR2	472 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		Q6ZSR6	202 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CADM3	Q8N126	398 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	AMER3	Q8N944	861 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR151	Q8TDV0	419 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	THRSP	Q92748	146 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KAT2A	Q92830	837 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KLK6	Q92876	244 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FGF11	Q92914	225 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FGF14	Q92915	247 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RITA1	Q96K30	269 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	BMF	Q96LC9	184 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	UBQLN3	Q9H347	655 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C5AR2	Q9P296	337 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PRODH2	Q9UF12	536 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	UTRN	P46939	3433 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0G2JN53	185 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CENPX	A8MT69	81 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		H0YIG0	161 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CTDSP2	O14595	271 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CHP2	O43745	196 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FCMR	O60667	390 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PTP4A3	O75365	173 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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