RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52E5	Q8NH55	327 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	DYRK2	Q92630	601 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TADA1	Q96BN2	335 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CPB2	Q96IY4	423 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4F4	Q96R69	305 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP5S	Q99766	215 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CTRC	Q99895	268 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MED10	Q9BTT4	135 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TREX1	Q9NSU2	369 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NAGK	Q9UJ70	344 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	KPTN	Q9Y664	436 aa		2.34	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	2.34	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	PP2D1	A8MPX8	630 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF212B	A8MTL3	300 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF724	A8MTY0	619 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	IDS	B3KWA1	339 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957		E7ESA3	106 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957		H7C0C1	242 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TOR1A	O14656	332 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SURF4	O15260	269 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFSF12	O43508	249 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TYROBP	O43914	113 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	CEACAM4	O75871	244 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	RBBP9	O75884	186 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP5L	O75964	103 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	LYPD3	O95274	346 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC24A	O95486	1093 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf105	O95561	183 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	HP	P00738	406 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	AMBP	P02760	352 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	IFNW1	P05000	195 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	FGF1	P05230	155 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	GPI	P06744	558 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	KLK1	P06870	262 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SERPINA6	P08185	405 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	DPEP1	P16444	411 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	PMCH	P20382	165 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	CNR1	P21554	472 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	IL12A	P29459	219 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR183	P32249	361 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC26A3	P40879	764 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC1A2	P43004	574 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	GNPDA1	P46926	289 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	RGR	P47804	291 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TFPI2	P48307	235 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TGM4	P49221	684 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	HLCS	P50747	726 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	LBX1	P52954	281 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXW4	P57775	412 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	RND3	P61587	244 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	PMS2P3	Q13401	168 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SERTAD2	Q14140	314 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	RPEL1	Q2QD12	228 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TIGIT	Q495A1	244 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	C5orf47	Q569G3	176 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	THEM4	Q5T1C6	240 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF691	Q5VV52	312 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		2.33	□□□□□ -2.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms