RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	SCAI	Q8N9R8	606 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	OR52N5	Q8NH56	324 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	NEUROG1	Q92886	237 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	TAAR8	Q969N4	342 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	PERP	Q96FX8	193 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137		Q96MF0	132 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	EPYC	Q99645	322 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	SH3GL1	Q99961	368 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	NANOG	Q9H9S0	305 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	HIVEP2	P31629	2446 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	FXYD1	O00168	92 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	AIM2	O14862	343 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	SLC22A2	O15244	555 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CD8A	P01732	235 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ZNF43	P17038	809 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	AQP1	P29972	269 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	SELENOP	P49908	381 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ATP5J2	P56134	94 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	PRPS1	P60891	318 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	NCALD	P61601	193 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CGB2	Q6NT52	195 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	LRRC58	Q96CX6	371 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	PRR14	Q9BWN1	585 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	SAR1A	Q9NR31	198 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	MS4A18	H0YCH9	400 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137		M0R082	166 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	WNT11	O96014	354 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	MT-ATP6	P00846	226 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	BGLAP	P02818	100 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CD247	P20963	164 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	GRPR	P30550	384 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	TTK	P33981	857 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ZNF83	P51522	516 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ARFIP2	P53365	341 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CRYBA2	P53672	197 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CDH11	P55287	796 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CDH12	P55289	794 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	SLC25A3	Q00325	362 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	LTB	Q06643	244 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	KLF10	Q13118	480 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	VEZF1	Q14119	521 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	VMAC	Q2NL98	169 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ZNF544	Q6NX49	715 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	LINGO2	Q7L985	606 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	SMYD1	Q8NB12	490 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	OR10A6	Q8NH74	314 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	TAMM41	Q96BW9	452 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	POM121	Q96HA1	1249 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	MED4	Q9NPJ6	270 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	SELENON	Q9NZV5	590 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	JMJD1C	Q15652	2540 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137		E7EQL1	145 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	CHP2	O43745	196 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	UPK3A	O75631	287 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CS-223	ENST00000551137	LYPD3	O95274	346 aa		10.04	□□□□□ -0.8

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