RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 EBF3Q9H4W6 596 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 ACKR4Q9NPB9 350 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 PRSS16Q9NQE7 514 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 CTPS2Q9NRF8 586 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 DUSP22Q9NRW4 184 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM74BQ9NUR3 256 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 RMND1Q9NWS8 449 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 MAT2BQ9NZL9 334 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM9Q9P0T7 183 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 GUCA1BQ9UMX6 200 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 STYXL1Q9Y6J8 313 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 FGD5Q6ZNL6 1462 aa3.13□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 C9orf84Q5VXU9 1444 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A1W2PPV9 198 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 NKX6-3A6NJ46 265 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 RNF212BA8MTL3 300 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 H3BMH7 237 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 hCG_2039718K7EN88 272 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 DFFAO00273 331 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 PLPP3O14495 311 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 WNT9BO14905 357 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 EPHB6O15197 1021 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 SSNA1O43805 119 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 HPGDSO60760 199 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 RFPL2O75678 378 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP5LO75964 103 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 GLSO94925 669 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 VAMP5O95183 116 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 KRT75O95678 551 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 FGF19O95750 216 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 IGLV2-14P01704 120 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 ORM1P02763 201 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 CALB1P05937 261 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 CDK1P06493 297 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 MELTFP08582 738 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC166P0CW27 439 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 DPEP1P16444 411 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 NDUFB7P17568 137 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 HLA-GP17693 338 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 CELP19835 753 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 FPR3P25089 353 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
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SYF2P1-201ENST00000550658 COILP38432 576 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 CYB561P49447 251 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 PRLHRP49683 370 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 RARRES1P49788 294 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 DLX5P56178 289 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 CLDN6P56747 220 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 CLDN20P56880 219 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 OR4D2P58180 307 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 KRTAP10-11P60412 298 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 PSME3P61289 254 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 RPS18P62269 152 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 AESQ08117 197 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF415Q09FC8 603 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 TPBGQ13641 420 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 POU6F1Q14863 301 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC9A3R2Q15599 337 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 ZBTB6Q15916 424 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 HLFQ16534 295 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 HAGHQ16775 308 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 DMRTC1Q5HYR2 192 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 FGD3Q5JSP0 725 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 PPM1LQ5SGD2 360 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 CCNJQ5T5M9 372 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 HACD4Q5VWC8 232 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 RESP18Q5W5W9 173 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIQKQ629K1 86 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 KIAA0895LQ68EN5 471 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 TCEAL6Q6IPX3 200 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM45BPQ6NSW5 357 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 ACSM5Q6NUN0 579 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM131AQ6UXB0 335 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 LANCL3Q6ZV70 420 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 CREB3L2Q70SY1 520 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 SHFQ7M4L6 423 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 HPS6Q86YV9 775 aa3.12□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF547Q8IVP9 402 aa3.12□□□□□ -1.91
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