RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 H3BN98 237 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 BHLHE40O14503 412 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 OR2T1O43869 369 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 AQP8O94778 261 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 PPP1R3DO95685 299 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 F13BP05160 661 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 CPN1P15169 458 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 GSTM3P21266 225 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 SLC9A3P48764 834 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 CRISP1P54107 249 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 RAD23AP54725 363 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 CARD18P57730 90 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 NUP107P57740 925 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 SLC35A1P78382 337 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 CDK5Q00535 292 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 PMS2P3Q13401 168 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 BCL2A1Q16548 175 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 SGCBQ16585 318 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 RFX4Q33E94 735 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 CDK20Q8IZL9 346 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 TFAP2CQ92754 450 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 UBE2FQ969M7 185 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 ZNF570Q96NI8 536 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 RDH12Q96NR8 316 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 PITX2Q99697 317 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 TSSK6Q9BXA6 273 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 ASPNQ9BXN1 380 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 VCX3BQ9H321 246 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 C8orf4Q9NR00 106 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 FAM118AQ9NWS6 357 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 TRAPPC4Q9Y296 219 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.27□□□□□ -1.24
CS-216ENST00000549221 RELNP78509 3460 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 A0A1W2PNV4 684 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ZNF716A6NP11 495 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CLCA1A8K7I4 914 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 H0YJX3 145 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 IMPA2O14732 288 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 BCKDKO14874 412 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SERPINI2O75830 405 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 NDUFB2O95178 105 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RCBTB2O95199 551 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SLC2A10O95528 541 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TGM6O95932 706 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ADORA3P0DMS8 318 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CAPGP40121 348 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 MLLT10P55197 1068 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RAC3P60763 192 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ESRRGP62508 458 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ERVK-25P63136 954 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PUDPQ08623 228 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 NFATC3Q12968 1075 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 GINS1Q14691 196 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PON3Q15166 354 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PGGHGQ32M88 737 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ALG10Q5BKT4 473 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SLX4IPQ5VYV7 408 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 C12orf73Q69YU5 71 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 USP51Q70EK9 711 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 FAM122BQ7Z309 247 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 GHDCQ8N2G8 530 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 MEIOBQ8N635 442 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SCAIQ8N9R8 606 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms