RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LZICQ8WZA0 190 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BOD1Q96IK1 185 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FOXC2Q99958 501 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ASPNQ9BXN1 380 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SEC14L4Q9UDX3 406 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CIB4A0PJX0 185 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAD51DO75771 328 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR5F1O95221 314 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGF2P01344 180 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 THRBP10828 461 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MPGP29372 298 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GSK3BP49841 420 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TGFBR3Q03167 851 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LTBQ06643 244 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPA1Q15181 289 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GABRA6Q16445 453 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 P3H2Q8IVL5 708 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MUCL1Q96DR8 90 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MUS81Q96NY9 551 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa14.24□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPG11Q96JI7 2443 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CXCR6O00574 342 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF432O94892 652 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RBM34P42696 430 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SELENOPP49908 381 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TAS2R41P59536 307 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PSME3P61289 254 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KEAP1Q14145 624 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STK11Q15831 433 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DEF8Q6ZN54 512 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FKRPQ9H9S5 495 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DSCAMO60469 2012 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CD53P19397 219 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNFRSF1BP20333 461 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR1E2P47887 323 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ART1P52961 327 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLDN17P56750 224 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PUDPQ08623 228 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PMS2P3Q13401 168 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF74Q16587 644 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADAM5Q6NVV9 412 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NIPAL3Q6P499 406 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CBLL1Q75N03 491 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UEVLDQ8IX04 471 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KDM8Q8N371 416 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR5J2Q8NH18 312 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TPD52L3Q96J77 140 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRRC1Q96M27 445 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PIP5K1AQ99755 562 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MS4A18H0YCH9 400 aa14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GSTA4O15217 222 aa14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC43A1O75387 559 aa14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KRT33AO76009 404 aa14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM107AO95990 144 aa14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CD3EP07766 207 aa14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTNP21246 168 aa14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CBLP22681 906 aa14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACKR1Q16570 336 aa14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms