RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 NXNL1Q96CM4 212 aa3.76□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 PAFAH2Q99487 392 aa3.76□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 NRTNQ99748 197 aa3.76□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa3.76□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 DPH5Q9H2P9 285 aa3.76□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 SPNS1Q9H2V7 528 aa3.76□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 OR51B5Q9H339 312 aa3.76□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 POLE3Q9NRF9 147 aa3.76□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 SMYD2Q9NRG4 433 aa3.76□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 BCAP29Q9UHQ4 241 aa3.76□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa3.76□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 L3MBTL1Q9Y468 752 aa3.76□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 CEPT1Q9Y6K0 416 aa3.76□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 SCN3AQ9NY46 2000 aa3.76□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa3.75□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 OR6C65A6NJZ3 312 aa3.75□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 A8MUA0 341 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 INAFM1C9JVW0 142 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 USP17L23D6RBM5 183 aa3.75□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 HCRTR2O43614 444 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 SUPT7LO94864 414 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 SYNGR4O95473 234 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 ETHE1O95571 254 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 TOMM40O96008 361 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 F10P00742 488 aa3.75□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 NUDT17P0C025 328 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 CCL3P10147 92 aa3.75□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 CD99P14209 185 aa3.75□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF708P17019 499 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 IL11P20809 199 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 GPX3P22352 226 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 PTPN6P29350 595 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 CLK1P49759 484 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 CTBP2P56545 445 aa3.75□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 GPX6P59796 221 aa3.75□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 SCGB2A2Q13296 93 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 GNA13Q14344 377 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 EFNB3Q15768 340 aa3.75□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 SYT10Q6XYQ8 523 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM64Q6YI46 380 aa3.75□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 OR4F6Q8NGB9 312 aa3.75□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.75□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 PPP3R2Q96LZ3 170 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 SFXN2Q96NB2 322 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 MS4A4EQ96PG1 132 aa3.75□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
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