RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521941.1

CTNNA1-231, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 3

Gene CTNNA1, Length 224 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-231	ENST00000521941	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	RHCG	Q9UBD6	479 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	APC	P25054	2843 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	MAST4	O15021	2626 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	NDUFAB1	O14561	156 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	CLOCK	O15516	846 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PIP5K1C	O60331	668 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	GMNN	O75496	209 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	VAMP5	O95183	116 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	OR5F1	O95221	314 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	OR6A2	O95222	327 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	GOSR1	O95249	250 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	LYPD3	O95274	346 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	FAM107A	O95990	144 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	HPR	P00739	348 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PLAU	P00749	431 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	IFNW1	P05000	195 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ADORA3	P0DMS8	318 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	HLA-DOB	P13765	273 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	DNASE1	P24855	282 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	HOXC12	P31275	282 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PCYT1A	P49585	367 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	UGT2B15	P54855	530 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	SELENOW	P63302	87 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PUDP	Q08623	228 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	KEAP1	Q14145	624 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	MELK	Q14680	651 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	P2RY6	Q15077	328 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PPA1	Q15181	289 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	IFI44L	Q53G44	452 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	BEX5	Q5H9J7	111 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	GLYAT	Q6IB77	296 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	C16orf89	Q6UX73	402 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	CBLL1	Q75N03	491 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	UEVLD	Q8IX04	471 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	OR5J2	Q8NH18	312 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	TMEM45B	Q96B21	275 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	MUCL1	Q96DR8	90 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PRRC1	Q96M27	445 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	OXGR1	Q96P68	337 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	EMC6	Q9BV81	110 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	NANS	Q9NR45	359 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	MED29	Q9NX70	200 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	MALT1	Q9UDY8	824 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	AKAP6	Q13023	2319 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	MS4A18	H0YCH9	400 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	KLF4	O43474	513 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	RNF13	O43567	381 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	SLC43A1	O75387	559 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	UPK3A	O75631	287 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	SEC14L2	O76054	403 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	IFNA8	P32881	189 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF83	P51522	516 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ART1	P52961	327 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	IST1	P53990	364 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF74	Q16587	644 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	FITM2	Q8N6M3	262 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		7.36	□□□□□ -1.23

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