RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 MC1RQ01726 317 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SMCO1Q147U7 214 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 RPE65Q16518 533 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF626Q68DY1 528 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PODNL1Q6PEZ8 512 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 COMTD1Q86VU5 262 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 OR6K3Q8NGY3 331 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 HRASLS2Q9NWW9 162 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 MBD2Q9UBB5 411 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1B0GTQ1 180 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 E9PI62 339 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A12O75746 678 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 AQP8O94778 261 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 STARP49675 285 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PRLHRP49683 370 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PGDP52209 483 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 MNTQ99583 582 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM74BQ9NUR3 256 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ASB6Q9NWX5 421 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SHISA7A6NL88 538 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 LMO7DNF2Z398 122 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PRAF2O60831 178 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ACTL6AO96019 429 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 GAAP10253 952 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ATF1P18846 271 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PPIBP23284 216 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 AHRP35869 848 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CDH11P55287 796 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CDK5Q00535 292 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ACSM2AQ08AH3 577 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 DYRK1AQ13627 763 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 DOC2AQ14183 400 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 KLHL26Q53HC5 615 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 BEX5Q5H9J7 111 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A30Q5SVS4 291 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ACSM2BQ68CK6 577 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 OR13C5Q8NGS8 318 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ORAI1Q96D31 301 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 VPS29Q9UBQ0 182 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 IL20RAQ9UHF4 553 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FMO6PO60774 539 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 LRP3O75074 770 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CMPK1P30085 196 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 LUMP51884 338 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 NAE1Q13564 534 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 C17orf64Q86WR6 236 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 KLHL36Q8N4N3 616 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM4Q8WVI0 70 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FAM117AQ9C073 453 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 RDH14Q9HBH5 336 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ASF1BQ9NVP2 202 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CACNA1EQ15878 2313 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 COLCA2A8K830 154 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 E7EQ34 232 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FAAHO00519 579 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GOSR2O14653 212 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 JMJD7P0C870 316 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 VSIG10L2P0DP72 767 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CASP6P55212 293 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TGIF1Q15583 401 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 STPG1Q5TH74 334 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ARL9Q6T311 187 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 LINGO2Q7L985 606 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FAM129CQ86XR2 697 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR52I2Q8NH67 350 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 I3L1I5 382 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PGRMC2O15173 223 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 AOAHP28039 575 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SOAT1P35610 550 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 DEFA6Q01524 100 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CHIT1Q13231 466 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms