RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DDIT4L	Q96D03	193 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CDC6	Q99741	560 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NCDN	Q9UBB6	729 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CD207	Q9UJ71	328 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TBX21	Q9UL17	535 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ICK	Q9UPZ9	632 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		7.44	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193		F8W036	122 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HR	O43593	1189 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SIX6	O95475	246 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	LCAT	P04180	440 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ATP1B1	P05026	303 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ADH6	P28332	368 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CD38	P28907	300 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR10A3	P58181	314 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	YPEL5	P62699	121 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	BLOC1S1	P78537	153 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TEK	Q02763	1124 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TPBG	Q13641	420 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CBFB	Q13951	182 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	LIPN	Q5VXI9	398 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ARSK	Q6UWY0	536 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR6V1	Q8N148	313 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DOK1	Q99704	481 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CUTC	Q9NTM9	273 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	COL4A5	P29400	1685 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SPTB	P11277	2137 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0B4J203	849 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193		A6NIZ1	184 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS23	O95084	383 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CXCL10	P02778	98 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RAB3A	P20336	220 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	EVX1	P49640	407 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC26A5	P58743	744 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RAP1B	P61224	184 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RAP1A	P62834	184 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DGCR2	P98153	550 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PLP2	Q04941	152 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GNMT	Q14749	295 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PARM1	Q6UWI2	310 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FRMD1	Q8N878	549 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	AMER3	Q8N944	861 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RSC1A1	Q92681	617 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CKAP5	Q14008	2032 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SULT2B1	O00204	365 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DVL2	O14641	736 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SERPINA5	P05154	406 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SRM	P19623	302 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HOXC8	P31273	242 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ADPRH	P54922	357 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	BTN1A1	Q13410	526 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TDG	Q13569	410 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GALE	Q14376	348 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RSU1	Q15404	277 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZG16B	Q96DA0	208 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FCRL1	Q96LA6	429 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HCRTR1	O43613	425 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CTNS	O60931	367 aa		7.43	□□□□□ -1.22

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