RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 UPK3AO75631 287 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 HLA-DOBP13765 273 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDT2P50583 147 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC7A2P52569 658 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN17P56750 224 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 TIMM23BQ5SRD1 257 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00114Q6XXX2 140 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 CARM1Q86X55 608 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC15A3Q8IY34 581 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 MICU2Q8IYU8 434 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 WFDC11Q8NEX6 87 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHAC1Q9H158 963 aa16.43■□□□□ 0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 UPB1Q9UBR1 384 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF115Q9Y4L5 304 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A15Q9Y619 301 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 ACANP16112 2415 aa16.43■□□□□ 0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC22O60826 627 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1E2P47887 323 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 GNGT1P63211 74 aa16.42■□□□□ 0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 C5orf46Q6UWT4 87 aa16.42■□□□□ 0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 WDR31Q8NA23 367 aa16.42■□□□□ 0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 SLC41A3Q96GZ6 507 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS27Q9BQR3 290 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM43Q9BTV4 400 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 EVA1AQ9H8M9 152 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 PARPBPQ9NWS1 579 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 SH3GLB1Q9Y371 365 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 USF3Q68DE3 2245 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 HS3ST1O14792 307 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2T1O43869 369 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF432O94892 652 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 VAMP5O95183 116 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 CD3EP07766 207 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 FUT4P22083 530 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF83P51522 516 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAM8P78325 824 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 IL1RL1Q01638 556 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 HIKESHIQ53FT3 197 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 CYBRD1Q53TN4 286 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 C20orf204Q6ZNR8 217 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF426Q9BUY5 554 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa16.41■□□□□ 0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 SHISA9B4DS77 424 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 MS4A18H0YCH9 400 aa16.4■□□□□ 0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 NQO1P15559 274 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF43P17038 809 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 MPGP29372 298 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 MS4A18Q3C1V0 323 aa16.4■□□□□ 0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 C10orf53Q8N6V4 93 aa16.4■□□□□ 0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 RASSF5Q8WWW0 418 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 PROX1Q92786 737 aa16.4■□□□□ 0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 OXGR1Q96P68 337 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 EPYCQ99645 322 aa16.4■□□□□ 0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa16.4■□□□□ 0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 KDELR2P33947 212 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 GSK3BP49841 420 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT2B15P54855 530 aa16.39■□□□□ 0.21
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SH3BP2-218ENST00000511185 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 NKAIN4Q8IVV8 208 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM123Q8N131 208 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC17Q8N6Y2 441 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 POMGNT2Q8NAT1 580 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6S1Q8NH40 331 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 PFN4Q8NHR9 129 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM255BQ8WV15 326 aa16.39■□□□□ 0.21
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