RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 SHISA2Q6UWI4 295 aa13.66□□□□□ -0.22
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SH3BP2-215ENST00000510074 C4orf33Q8N1A6 199 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 GPR137CQ8N3F9 429 aa13.66□□□□□ -0.22
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SH3BP2-215ENST00000510074 NELFAQ9H3P2 528 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF696Q9H7X3 374 aa13.66□□□□□ -0.22
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SH3BP2-215ENST00000510074 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
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SH3BP2-215ENST00000510074 OR8J2Q8NGG1 315 aa13.65□□□□□ -0.22
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SH3BP2-215ENST00000510074 SYPL1Q16563 259 aa13.64□□□□□ -0.23
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SH3BP2-215ENST00000510074 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 C1orf140Q5VVS0 124 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 WBP2NLQ6ICG8 309 aa13.64□□□□□ -0.23
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SH3BP2-215ENST00000510074 ANKFN1Q8N957 763 aa13.64□□□□□ -0.23
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SH3BP2-215ENST00000510074 SLC25A36Q96CQ1 311 aa13.64□□□□□ -0.23
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SH3BP2-215ENST00000510074 SLC35A5Q9BS91 424 aa13.64□□□□□ -0.23
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SH3BP2-215ENST00000510074 PRDM4Q9UKN5 801 aa13.64□□□□□ -0.23
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SH3BP2-215ENST00000510074 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa13.63□□□□□ -0.23
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SH3BP2-215ENST00000510074 GSNP06396 782 aa13.63□□□□□ -0.23
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SH3BP2-215ENST00000510074 CEACAM16Q2WEN9 425 aa13.63□□□□□ -0.23
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SH3BP2-215ENST00000510074 OR4M2Q8NGB6 313 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC6A7Q99884 636 aa13.63□□□□□ -0.23
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SH3BP2-215ENST00000510074 DUSP13Q9UII6 198 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF432O94892 652 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 AHSA1O95433 338 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 AVPP01185 164 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 SHBGP04278 402 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 GLRXP35754 106 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 PIGFQ07326 219 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 GSG1Q2KHT4 349 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-215ENST00000510074 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
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