RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505583.5

GYPB-205, Transcript of glycophorin B (MNS blood group), human

TSL 1 (best)

Gene GYPB, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GYPB-205	ENST00000505583	NR2F1	P10589	423 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	DAO	P14920	347 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	IL7R	P16871	459 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	ITGA2	P17301	1181 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	CXCR1	P25024	350 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	GIF	P27352	417 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	S100A3	P33764	101 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	VSNL1	P62760	191 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	HOXC5	Q00444	222 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	EGR4	Q05215	589 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	SMU1	Q2TAY7	513 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	GTDC1	Q4AE62	458 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	TMEM225	Q6GV28	225 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	NIPAL3	Q6P499	406 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	SERPINA11	Q86U17	422 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	COMTD1	Q86VU5	262 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	CARM1	Q86X55	608 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	CMIP	Q8IY22	773 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	CDK20	Q8IZL9	346 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	CADM2	Q8N3J6	435 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	PMM1	Q92871	262 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	VPS33A	Q96AX1	596 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	PANX1	Q96RD7	426 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	NOX3	Q9HBY0	568 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	FKBP7	Q9Y680	259 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	DYSF	O75923	2080 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583		A8MVM7	634 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	SDHD	O14521	159 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	WNT9B	O14905	357 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	WIPF1	O43516	503 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	KRT33A	O76009	404 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	PDE5A	O76074	875 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	VENTX	O95231	258 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	SERPINE1	P05121	402 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	PGR	P06401	933 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	ADRA2A	P08913	450 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	TFPT	P0C1Z6	253 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	MYZAP	P0CAP1	466 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	PNMT	P11086	282 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	ETFA	P13804	333 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	CBR1	P16152	277 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	LBP	P18428	481 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	BGN	P21810	368 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	SLC1A6	P48664	564 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	PPOX	P50336	477 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	MAP2K6	P52564	334 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	CLDN17	P56750	224 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	HPCA	P84074	193 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	RIN1	Q13671	783 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	CCNI	Q14094	377 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	SQLE	Q14534	574 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	ADRM1	Q16186	407 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	GSTA3	Q16772	222 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	ATG16L1	Q676U5	607 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	OGFOD2	Q6N063	350 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	RINL	Q6ZS11	566 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	SPATA21	Q7Z572	469 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	MDP1	Q86V88	176 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	ZNF786	Q8N393	782 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	NUP37	Q8NFH4	326 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GYPB-205	ENST00000505583	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6

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