RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	POU3F4	P49335	361 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PDX1	P52945	283 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TAS2R20	P59543	309 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	DSC1	Q08554	894 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	LTB4R	Q15722	352 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF511	Q8NB15	262 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	WDR92	Q96MX6	357 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574		V9GYH0	126 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	IFITM2	Q01629	132 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR10K2	Q6IF99	312 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	GPR174	Q9BXC1	333 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	C12orf10	Q9HB07	376 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CBLC	Q9ULV8	474 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1B0GWA3	101 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	HR	O43593	1189 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	F13B	P05160	661 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CALCB	P10092	127 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF28	P17035	718 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ITGB7	P26010	798 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	GDI1	P31150	447 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CD79B	P40259	229 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	MMP15	P51511	669 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CLDN2	P57739	230 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	LYPD8	Q6UX82	237 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM64	Q6YI46	380 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CMC2	Q9NRP2	79 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	MOK	Q9UQ07	419 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF175	Q9Y473	711 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CCS	O14618	274 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	RFX2	P48378	723 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLAMF9	Q96A28	289 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	AIP	O00170	330 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CNR1	P21554	472 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	FXYD4	P59646	89 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLC22A25	Q6T423	547 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	COX15	Q7KZN9	410 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	POFUT1	Q9H488	388 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TTLL8	A6PVC2	850 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	GPR75	O95800	540 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM225B	P0DP42	221 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	RAG2	P55895	527 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	WNT3	P56703	355 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	REEP5	Q00765	189 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	BAMBI	Q13145	260 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	LURAP1	Q96LR2	239 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLC22A12	Q96S37	553 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31

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