RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494401.5

SNX5-216, Transcript of sorting nexin 5, human

TSL 5

Gene SNX5, Length 656 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX5-216	ENST00000494401	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	C12orf10	Q9HB07	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	GLTP	Q9NZD2	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401		M0R233	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	WWP2	O00308	870 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	CHP2	O43745	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	DNAJB6	O75190	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	ZNF432	O94892	652 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	TGM6	O95932	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	PAH	P00439	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	C1QC	P02747	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	TCRB	P04435	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	GUSB	P08236	651 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	ELANE	P08246	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	POU2F2	P09086	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	LAMP2	P13473	410 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	ADRB3	P13945	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	ELK1	P19419	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	DNASE1	P24855	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	SLC6A6	P31641	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	TRIM23	P36406	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	OMP	P47874	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	PRKAG1	P54619	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	GAS1	P54826	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	GMFB	P60983	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	RAP2B	P61225	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	IL10RA	Q13651	578 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	CAMK1	Q14012	370 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	FHL2	Q14192	279 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	GPR176	Q14439	515 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	CEBPE	Q15744	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	GRK1	Q15835	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	ZNF77	Q15935	545 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	NIPAL3	Q6P499	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	MED25	Q71SY5	747 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	LNX2	Q8N448	690 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	OR5W2	Q8NH69	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	GANC	Q8TET4	914 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	FGF11	Q92914	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	COX14	Q96I36	57 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	OR7D2	Q96RA2	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-216	ENST00000494401	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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