RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488601.6

POLR1C-208, Transcript of RNA polymerase I and III subunit C, human

TSL 2

Gene POLR1C, Length 973 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1C-208	ENST00000488601	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ZWILCH	Q9H900	591 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ADAM20	O43506	726 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PCDH7	O60245	1069 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PROP1	O75360	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	NDUFS3	O75489	264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	RALB	P11234	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SELL	P14151	372 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	FER	P16591	822 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	TNFSF8	P32971	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	CLDN20	P56880	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	UBE2H	P62256	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	UBXN1	Q04323	297 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ASPG	Q86U10	573 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	GAL3ST1	Q99999	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	CTDSP2	O14595	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	NIPSNAP2	O75323	286 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SLC22A3	O75751	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ETFA	P13804	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	NPR2	P20594	1047 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SAT1	P21673	171 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SERPINB6	P35237	376 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	MSH2	P43246	934 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SLC15A1	P46059	708 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	FBXW4	P57775	412 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	LCP2	Q13094	533 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	KLF10	Q13118	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	FHL2	Q14192	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	KRT31	Q15323	416 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	BBOF1	Q8ND07	529 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	DDO	Q99489	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63	2e-6	■■■□□ 14.9
POLR1C-208	ENST00000488601	TNXB	P22105	4242 aa		4.84	□□□□□ -1.64
POLR1C-208	ENST00000488601	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
POLR1C-208	ENST00000488601		A8MXK9	166 aa		4.83	□□□□□ -1.64
POLR1C-208	ENST00000488601	HAT1	O14929	419 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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