RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GTH9 108 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 AQP7P3A6NL99 342 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 PDLIM1O00151 329 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 SOCS2O14508 198 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 IDH3BO43837 385 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 PIP5K1CO60331 668 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 WDR1O75083 606 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 PTP4A3O75365 173 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 NDUFB2O95178 105 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 OR6A2O95222 327 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 APEHP13798 732 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 ENPP1P22413 925 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 PEX2P28328 305 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 GRNP28799 593 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 GRPRP30550 384 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 GPR4P46093 362 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 RPS6KA3P51812 740 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 CLDN15P56746 228 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 CLDN20P56880 219 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 PMS2P3Q13401 168 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 POU4F3Q15319 338 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 OR7A5Q15622 319 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 FBXW10Q5XX13 1052 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 LPCAT4Q643R3 524 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 SMARCD3Q6STE5 483 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 HDDC2Q7Z4H3 204 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 HS3ST5Q8IZT8 346 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 OR52L1Q8NGH7 329 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 SMPDL3BQ92485 455 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A36Q96CQ1 311 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 PRRG3Q9BZD7 231 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 TMEM185BQ9H7F4 350 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 CHST11Q9NPF2 352 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 SPRR3Q9UBC9 169 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 SIGLEC7Q9Y286 467 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 SLC5A6Q9Y289 635 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 CDH10Q9Y6N8 788 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PNR3 127 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PNV4 684 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 FIGNL2A6NMB9 653 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 PLPP3O14495 311 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 CDC42EP2O14613 210 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 IMPA2O14732 288 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 TNFSF11O14788 317 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 SHC1P29353 583 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 SLC6A6P31641 620 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 UQCRC1P31930 480 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 STARP49675 285 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 LTBQ06643 244 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 PUDPQ08623 228 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 LAPTM4AQ15012 233 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 TMEM225Q6GV28 225 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 KLHL17Q6TDP4 642 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 ZNF620Q6ZNG0 422 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 PXKQ7Z7A4 578 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 P3H2Q8IVL5 708 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 UBQLNLQ8IYU4 475 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 ANKK1Q8NFD2 765 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 FAM57AQ8TBR7 257 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 MOGAT1Q96PD6 335 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 SLC29A1Q99808 456 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 GABARAPL3Q9BY60 117 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 RNF122Q9H9V4 155 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 CALHM2Q9HA72 323 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 SMURF2Q9HAU4 748 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 GLRX2Q9NS18 164 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 ASF1BQ9NVP2 202 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 REV1Q9UBZ9 1251 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 CAMK2AQ9UQM7 478 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 ZNF835Q9Y2P0 537 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 NOX1Q9Y5S8 564 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 CD8B2A6NJW9 211 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 NPIPA2E9PIF3 369 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 NPIPA3F8WFD2 350 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 M0R082 166 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 GPR171O14626 319 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 PRRG2O14669 202 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 CXCL13O43927 109 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 ADORA3P0DMS8 318 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 POU2F1P14859 743 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 ABOP16442 354 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 SMSP52788 366 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 CRISP1P54107 249 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.46□□□□□ -0.73
NISCH-211ENST00000488243 NPRL3Q12980 569 aa10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms