RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 MT-ATP6P00846 226 aa23.63■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 KDELR2P33947 212 aa23.63■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 NTF4P34130 210 aa23.63■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 TESK1Q15569 626 aa23.63■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 NCMAPQ5T1S8 102 aa23.63■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM108Q6UXF1 575 aa23.63■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 DEF8Q6ZN54 512 aa23.63■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 GPR137CQ8N3F9 429 aa23.63■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 C17orf78Q8N4C9 275 aa23.63■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ZIC4Q8N9L1 334 aa23.63■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SCAIQ8N9R8 606 aa23.63■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC7A7Q9UM01 511 aa23.63■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 AMDHD2Q9Y303 409 aa23.63■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 TPST2O60704 377 aa23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 WNT11O96014 354 aa23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CD53P19397 219 aa23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 AHCYP23526 432 aa23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 LIPEQ05469 1076 aa23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CYBRD1Q53TN4 286 aa23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM171Q8WVE6 324 aa23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 MUS81Q96NY9 551 aa23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 WFDC6Q9BQY6 131 aa23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 RCE1Q9Y256 329 aa23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 AKAP6Q13023 2319 aa23.62■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 DYNC1I1O14576 645 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 HS3ST1O14792 307 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SNX3O60493 162 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 UMPSP11172 480 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PTNP21246 168 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SELENOPP49908 381 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 P2RY4P51582 365 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PRPS1P60891 318 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 GABRA6Q16445 453 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 EPHX4Q8IUS5 362 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC41A3Q96GZ6 507 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 RADILQ96JH8 1075 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PIP5K1AQ99755 562 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 POU2F3Q9UKI9 436 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 MGAT4BQ9UQ53 548 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CSMD1Q96PZ7 3565 aa23.61■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF726A6NNF4 738 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ITGA5P08648 1049 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 DRD4P21917 467 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PRDX6P30041 224 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC7A2P52569 658 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 BSPH1Q075Z2 132 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 NPTX1Q15818 432 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PIK3C3Q8NEB9 887 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC19A3Q9BZV2 496 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CXXC4Q9H2H0 198 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CXorf56Q9H5V9 222 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 NANSQ9NR45 359 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CMTM6Q9NX76 183 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 NOX1Q9Y5S8 564 aa23.6■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 FREM1Q5H8C1 2179 aa23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CSMD2Q7Z408 3487 aa23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PTAFRP25105 342 aa23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 LOXP28300 417 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF83P51522 516 aa23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PUDPQ08623 228 aa23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 HACD2Q6Y1H2 254 aa23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC15A3Q8IY34 581 aa23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF611Q8N823 705 aa23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 OR5J2Q8NH18 312 aa23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 FBXW5Q969U6 566 aa23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PCDHAC1Q9H158 963 aa23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ALG2Q9H553 416 aa23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 FAIMQ9NVQ4 179 aa23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 USP22Q9UPT9 525 aa23.59■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A1W2PR80 420 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 M0R1B8 84 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF682O95780 498 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CH25HO95992 272 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PLAUP00749 431 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 BGLAPP02818 100 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ADORA3P0DMS8 318 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PAX7P23759 505 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 GYS2P54840 703 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SELENOWP63302 87 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 FKBP9P1Q75LS8 142 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM204Q9BSN7 226 aa23.58■■□□□ 1.37
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