RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 MPDZO75970 2070 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 DPRXA6NFQ7 191 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 CXCR6O00574 342 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 NDUFAB1O14561 156 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 GSTA4O15217 222 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 UPK3AO75631 287 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 KRT33AO76009 404 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 MT-ATP6P00846 226 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 CD53P19397 219 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 MPGP29372 298 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 GSK3BP49841 420 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 TAS2R41P59536 307 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 IL1RL1Q01638 556 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 TGFBR3Q03167 851 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 LGALS3BPQ08380 585 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 PMS2P3Q13401 168 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 C1DQ13901 141 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 OR7E24Q6IFN5 339 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 DEF8Q6ZN54 512 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SSX8Q7RTT4 187 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 UEVLDQ8IX04 471 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SCAIQ8N9R8 606 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 OR52N5Q8NH56 324 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 MBD6Q96DN6 1003 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 MPP4Q96JB8 637 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 LRRC37BQ96QE4 947 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ABCD2Q9UBJ2 740 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.05□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 PDZD2O15018 2839 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PR80 420 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 OR6C65A6NJZ3 312 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 PLPP3O14495 311 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 DCTN3O75935 186 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ZNF432O94892 652 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 OR5F1O95221 314 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 CH25HO95992 272 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 HPRP00739 348 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SERPINA1P01009 418 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 CD3EP07766 207 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 HLA-DOBP13765 273 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 AHCYP23526 432 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ZNF74Q16587 644 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 CBLL1Q75N03 491 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 LINGO2Q7L985 606 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 LRRC17Q8N6Y2 441 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 WDR31Q8NA23 367 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 OR5J2Q8NH18 312 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 LZICQ8WZA0 190 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 TXNDC15Q96J42 360 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 CCT8L2Q96SF2 557 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ZNF426Q9BUY5 554 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SPAG4Q9NPE6 437 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 NANSQ9NR45 359 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 TAS2R5Q9NYW4 299 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ADA2Q9NZK5 511 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 NPAP1Q9NZP6 1156 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 RCE1Q9Y256 329 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.04□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.03□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.03□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 C11orf98E9PRG8 122 aa8.03□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 CLOCKO15516 846 aa8.03□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SLC43A1O75387 559 aa8.03□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 OR6A2O95222 327 aa8.03□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ZNF682O95780 498 aa8.03□□□□□ -1.12
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