RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	UEVLD	Q8IX04	471 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM45B	Q96B21	275 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	PERP	Q96FX8	193 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	MALT1	Q9UDY8	824 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	BAG5	Q9UL15	447 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	LRRN3	E7EW58	273 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	CHP2	O43745	196 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	OR6A2	O95222	327 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ITGA5	P08648	1049 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	AHCY	P23526	432 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	GZMM	P51124	257 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	NPTX1	Q15818	432 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	GABRA6	Q16445	453 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF613	Q6PF04	617 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	CARM1	Q86X55	608 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	MICU2	Q8IYU8	434 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	NEUROG1	Q92886	237 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	MBD6	Q96DN6	1003 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF583	Q96ND8	569 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	OXGR1	Q96P68	337 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	USF3	Q68DE3	2245 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf98	E9PRG8	122 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ABCD4	O14678	606 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	HS3ST1	O14792	307 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	FMO6P	O60774	539 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SLC43A1	O75387	559 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF682	O95780	498 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CD99	P14209	185 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MPG	P29372	298 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	LSP1	P33241	339 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	OR1E2	P47887	323 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	P2RY4	P51582	365 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SLC7A2	P52569	658 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SLC22A25	Q6T423	547 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC80	Q76M96	950 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	FBXW5	Q969U6	566 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	PLCE1	Q9P212	2302 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	GMNC	A6NCL1	334 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	DPRX	A6NFQ7	191 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGEF9	O43307	516 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	UPK3A	O75631	287 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CH25H	O95992	272 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	BGLAP	P02818	100 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	ADORA3	P0DMS8	318 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CDH11	P55287	796 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	LIPE	Q05469	1076 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	VEZF1	Q14119	521 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	LZIC	Q8WZA0	190 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	RADIL	Q96JH8	1075 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	EMC6	Q9BV81	110 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CMTM6	Q9NX76	183 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SSR4-208	ENST00000471880	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		13.01	□□□□□ -0.33

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