RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM122B	Q7Z309	247 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	PXK	Q7Z7A4	578 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM163	Q8TC26	289 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	APH1B	Q8WW43	257 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	UBE2F	Q969M7	185 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	KLHL15	Q96M94	604 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	SFXN2	Q96NB2	322 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	SNX18	Q96RF0	628 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	DDO	Q99489	341 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	DUSP21	Q9H596	190 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0J9YW62	118 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PNV4	684 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529		M0R082	166 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	AHCYL1	O43865	530 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	LYN	P07948	512 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	TFPI	P10646	304 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	CPN1	P15169	458 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	CRHBP	P24387	322 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	MAGEA5	P43359	124 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	CD97	P48960	835 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	DIO1	P49895	249 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	PLGLB1	Q02325	96 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	OR7A5	Q15622	319 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	GGN	Q86UU5	652 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	IFT27	Q9BW83	186 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	CHST11	Q9NPF2	352 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	INIP	Q9NRY2	104 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	MGA	Q8IWI9	3026 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	AQP7P3	A6NL99	342 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	SNTN	A6NMZ2	147 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529		H3BML4	177 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	SULT2B1	O00204	365 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	PRKY	O43930	277 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	C1QL1	O75973	258 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	OR6A2	O95222	327 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	IFNG	P01579	166 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	PDGFA	P04085	211 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF708	P17019	499 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	PTN	P21246	168 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	SHC1	P29353	583 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	LHX2	P50458	406 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	CLDN15	P56746	228 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	PUDP	Q08623	228 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	POU4F3	Q15319	338 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	TOMM20	Q15388	145 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC103	Q8IW40	242 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	PTP4A1	Q93096	173 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5B2	Q96R09	309 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	CLN6	Q9NWW5	311 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	RASD1	Q9Y272	281 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRAF4-208	ENST00000469529	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		11.43	□□□□□ -0.58

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