RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-205ENST00000467594 CLDN17P56750 224 aa13.53□□□□□ -0.24
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NISCH-205ENST00000467594 C1DQ13901 141 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
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NISCH-205ENST00000467594 ZNF544Q6NX49 715 aa13.53□□□□□ -0.24
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NISCH-205ENST00000467594 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
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NISCH-205ENST00000467594 CBLN4Q9NTU7 201 aa13.53□□□□□ -0.24
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NISCH-205ENST00000467594 A0A1B0GX12 115 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-205ENST00000467594 E7EQL1 145 aa13.52□□□□□ -0.25
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NISCH-205ENST00000467594 FMO6PO60774 539 aa13.52□□□□□ -0.25
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NISCH-205ENST00000467594 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
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NISCH-205ENST00000467594 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
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NISCH-205ENST00000467594 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-205ENST00000467594 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-205ENST00000467594 SH3GL1Q99961 368 aa13.52□□□□□ -0.25
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NISCH-205ENST00000467594 C3orf36Q3SXR2 165 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-205ENST00000467594 TBRG1Q3YBR2 411 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-205ENST00000467594 HIKESHIQ53FT3 197 aa13.51□□□□□ -0.25
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NISCH-205ENST00000467594 SLC41A3Q96GZ6 507 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-205ENST00000467594 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
NISCH-205ENST00000467594 MCHR1Q99705 422 aa13.51□□□□□ -0.25
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NISCH-205ENST00000467594 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
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NISCH-205ENST00000467594 IGHV4-39P01824 125 aa13.5□□□□□ -0.25
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NISCH-205ENST00000467594 CDH12P55289 794 aa13.5□□□□□ -0.25
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NISCH-205ENST00000467594 LGALS3BPQ08380 585 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-205ENST00000467594 SELPLGQ14242 412 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-205ENST00000467594 DUSP7Q16829 419 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-205ENST00000467594 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
NISCH-205ENST00000467594 COQ5Q5HYK3 327 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-205ENST00000467594 C11orf71Q6IPW1 123 aa13.5□□□□□ -0.25
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