RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAPPC4Q9Y296 219 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 MED31Q9Y3C7 131 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 U3KQV3 271 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.52□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC22A20A6NK97 555 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF814B7Z6K7 855 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 H3BNX3 289 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2T1O43869 369 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 RAMP1O60894 148 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT36O76013 467 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 OR7A10O76100 309 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 AQP8O94778 261 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CCNB2O95067 398 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 STSP08842 583 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 GLI4P10075 376 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 FASP25445 335 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 GRPRP30550 384 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR4P46093 362 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 LIMS1P48059 325 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 HMGA2P52926 109 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 NUP107P57740 925 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ID3Q02535 119 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 PRKCDQ05655 676 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 PMPCAQ10713 525 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF74Q16587 644 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 FCRLAQ7L513 359 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 FJX1Q86VR8 437 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC103Q8IW40 242 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4K5Q8NGD3 323 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 BPIFA2Q96DR5 249 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 PKP2Q99959 881 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC19A3Q9BZV2 496 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 C12orf49Q9H741 205 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 MEMO1Q9Y316 297 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CD8B2A6NJW9 211 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRTM2O43300 516 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 OR10H3O60404 316 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 E2F6O75461 281 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 TOXO94900 526 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 BAG2O95816 211 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 LDLRP01130 860 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 HIST1H2ABP04908 130 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 PLA2G2AP14555 144 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 PRKACGP22612 351 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ADMP35318 185 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 PTGER4P35408 488 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 OMPP47874 163 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 P2RY4P51582 365 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CTBP2P56545 445 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 IL1RL1Q01638 556 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 PMS2P3Q13401 168 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP6AP1Q15904 470 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 CDK20Q8IZL9 346 aa7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ANKRD28-208ENST00000463533 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms