RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 DSCR9P59020 149 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 NAAAQ02083 359 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 HGFACQ04756 655 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNA13Q14344 377 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB35Q15286 201 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADIPOQQ15848 244 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 MSMPQ1L6U9 139 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 NXNQ6DKJ4 435 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM225Q6GV28 225 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 NIPAL3Q6P499 406 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 EPGNQ6UW88 154 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM123Q8N131 208 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 PROX1Q92786 737 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAAR8Q969N4 342 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35B4Q969S0 331 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF75AQ96N20 296 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 FKRPQ9H9S5 495 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOX3Q9HBY0 568 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 A4GALTQ9NPC4 353 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CA10Q9NS85 328 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CALML5Q9NZT1 146 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 GMEB1Q9Y692 573 aa7.34□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A096LPE4 126 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A096LPI6 279 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1B0GWA3 101 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PPZ6 126 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLCO1B7G3V0H7 640 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLIC1O00299 241 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBDO15205 165 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 AHSA1O95433 338 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANP32DO95626 131 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 WNT11O96014 354 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARAFP10398 606 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 UQCRBP14927 111 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLDN17P56750 224 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 TGFBR3Q03167 851 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 FADDQ13158 208 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 EFNB3Q15768 340 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF311Q5JNZ3 666 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAGE3Q5JUK9 113 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATG16L1Q676U5 607 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD16Q6P6B7 361 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ITCHQ96J02 903 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBTB18Q99592 522 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 EBF4Q9BQW3 602 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 C12orf10Q9HB07 376 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM45AQ9NWC5 275 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 VAPAQ9P0L0 249 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 RCE1Q9Y256 329 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 RASD1Q9Y272 281 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.33□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF212BA8MTL3 300 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRN3E7EW58 273 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 MS4A18H0YCH9 400 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 M0R082 166 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEC14L2O76054 403 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDE5AO76074 875 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 BGLAPP02818 100 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSF3P09919 207 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 HLA-DOBP13765 273 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ETS2P15036 469 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 USF1P22415 310 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRPRP30550 384 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRKAR1BP31321 381 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 NR4A2P43354 598 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 COPZ1P61923 177 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHRNB3Q05901 458 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.32□□□□□ -1.24
GAPDHP28-201ENST00000455134 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms