RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	MMP25	Q9NPA2	562 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	MOK	Q9UQ07	419 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	FITM1	A5D6W6	292 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	IFITM5	A6NNB3	132 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	C17orf105	B2RV13	164 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	PDCD5	O14737	125 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM127	O75204	238 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ZFPL1	O95159	310 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	TXNDC12	O95881	172 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	PRKCA	P17252	672 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	STOM	P27105	288 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	CD1C	P29017	333 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	UQCRC1	P31930	480 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	RAG2	P55895	527 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	SLC37A1	P57057	533 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	EGR4	Q05215	589 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	BIK	Q13323	160 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	DYRK1A	Q13627	763 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	SLC6A19	Q695T7	634 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	CBLN3	Q6UW01	205 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF511	Q8NB15	262 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	OR2M2	Q96R28	347 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	NANS	Q9NR45	359 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1B0GVT2	93 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ACOD1	A6NK06	481 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	AIP	O00170	330 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ADRB1	P08588	477 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	GRPR	P30550	384 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	SDHA	P31040	664 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	PPIC	P45877	212 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	CD276	Q5ZPR3	534 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	APOOL	Q6UXV4	268 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	KNL1	Q8NG31	2342 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ORAI1	Q96D31	301 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	EMC7	Q9NPA0	242 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	LANCL2	Q9NS86	450 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	PSMD9	O00233	223 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	FABP7	O15540	132 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	SERPINI2	O75830	405 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	DPP4	P27487	766 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	LTB	Q06643	244 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ELOC	Q15369	112 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ALG10	Q5BKT4	473 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	TCTE1	Q5JU00	501 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF524	Q96C55	264 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	TSSK2	Q96PF2	358 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	OR51J1	Q9H342	316 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	HSPB11	Q9Y547	144 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	SCD	O00767	359 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF264	O43296	627 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	UTS2	O95399	124 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	HPGD	P15428	266 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	GFER	P55789	205 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	CTXN1	P60606	82 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	MAP6	Q96JE9	813 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	SLC38A3	Q99624	504 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	LPAR4	Q99677	370 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TOM1-210	ENST00000449058	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06

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