RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 NHLRC3Q5JS37 347 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM89BQ8N5H3 189 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 OR4M1Q8NGD0 313 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 J3QW42 95 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRC-209ENST00000442510 OSMP13725 252 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-209ENST00000442510 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.583e-7■■■□□ 14.6
PTPRC-209ENST00000442510 AK4P27144 223 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
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