RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 GFRA2O00451 464 aa13.45□□□□□ -0.26
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PTPRU-204ENST00000428026 KCNIP4Q6PIL6 250 aa13.45□□□□□ -0.26
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PTPRU-204ENST00000428026 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
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PTPRU-204ENST00000428026 RABIFP47224 123 aa13.44□□□□□ -0.26
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PTPRU-204ENST00000428026 ZNF439Q8NDP4 499 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 FKRPQ9H9S5 495 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 BET1O15155 118 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 NXPH3O95157 252 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 NSA2O95478 260 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 HLA-FP30511 346 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 ADAM5Q6NVV9 412 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 STEAP1BQ6NZ63 245 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-204ENST00000428026 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa13.44□□□□□ -0.26
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