RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NCK1P16333 377 aa22■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LGALS3BPQ08380 585 aa22■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MFSD13AQ14CX5 517 aa22■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BEX5Q5H9J7 111 aa22■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CBLL1Q75N03 491 aa22■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NKAIN4Q8IVV8 208 aa22■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCAIQ8N9R8 606 aa22■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RIMS3Q9UJD0 308 aa22■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa22■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CORINQ9Y5Q5 1042 aa22■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAD51DO75771 328 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR5F1O95221 314 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF43P17038 809 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GGT1P19440 569 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FUT4P22083 530 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAS2R41P59536 307 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC25A3Q00325 362 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STK11Q15831 433 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C9orf135Q5VTT2 229 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NHLRC1Q6VVB1 395 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C10orf53Q8N6V4 93 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF148Q8N7C7 305 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAS2R16Q9NYV7 291 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADA2Q9NZK5 511 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UPB1Q9UBR1 384 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EGFL7Q9UHF1 273 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNX13Q9Y5W8 968 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF432O94892 652 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF682O95780 498 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SERPINA1P01009 418 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HLA-DOBP13765 273 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IST1P53990 364 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLDN17P56750 224 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GABRA6Q16445 453 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF74Q16587 644 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NIPAL3Q6P499 406 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PAMR1Q6UXH9 720 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM156AQ8NDB6 213 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LZICQ8WZA0 190 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLPPR2Q96GM1 343 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MUS81Q96NY9 551 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ASPNQ9BXN1 380 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADAM21Q9UKJ8 722 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A4GNTQ9UNA3 340 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR5H1A6NKK0 313 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLPP3O14495 311 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CH25HO95992 272 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MT-ATP6P00846 226 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NQO1P15559 274 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PMS2P3Q13401 168 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRT72Q14CN4 511 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TIMM23BQ5SRD1 257 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINGO2Q7L985 606 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PGAM4Q8N0Y7 254 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC17Q8N6Y2 441 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POMGNT2Q8NAT1 580 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM255BQ8WV15 326 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NINJ1Q92982 152 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC19A3Q9BZV2 496 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CIB4A0PJX0 185 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UPK3AO75631 287 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLAUP00749 431 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UGT2B15P54855 530 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C1DQ13901 141 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPA1Q15181 289 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TESK1Q15569 626 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 P2RY8Q86VZ1 359 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDFY1Q8IWB7 410 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR5J2Q8NH18 312 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PFN4Q8NHR9 129 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM162AQ96A26 154 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSH2DQ96JZ2 352 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM204Q9BSN7 226 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD300AQ9UGN4 299 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RCE1Q9Y256 329 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 J3KTA2 159 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FFAR1O14842 300 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATE1O95260 518 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 THRBP10828 461 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MPGP29372 298 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 YAP1P46937 504 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IL1RL1Q01638 556 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PUDPQ08623 228 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FXNQ16595 210 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms