RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 LGI1O95970 557 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 SBK3P0C264 359 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 HTR5AP47898 357 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 AGAP6Q5VW22 663 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 MARCH3Q86UD3 253 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 UBE2FQ969M7 185 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 AGAP4Q96P64 663 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 NRIP3Q9NQ35 241 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 USP54Q70EL1 1684 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 SHC1P29353 583 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 BIDP55957 195 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 IL13RA1P78552 427 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 NIPAL3Q6P499 406 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF454Q8N9F8 522 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 PADI1Q9ULC6 663 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ECM29Q5VYK3 1845 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 HMGN4O00479 90 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ALOX12BO75342 701 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ALDOBP05062 364 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 LIPCP11150 499 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 TUBG1P23258 451 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF385BQ569K4 471 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 FRMD1Q8N878 549 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 TXNDC15Q96J42 360 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ARL5BQ96KC2 179 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ARF1P84077 181 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 LAX1Q8IWV1 398 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 CLDN22Q8N7P3 220 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 OR13C9Q8NGT0 318 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 CPT1CQ8TCG5 803 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 A8MVM7 634 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 B4DXG7 233 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ACTL6BO94805 426 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 CTSLP07711 333 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF44P15621 663 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 EFNA3P52797 238 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 CLDN12P56749 244 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 Q499Y3 187 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 GLB1L2Q8IW92 636 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF511Q8NB15 262 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR157Q5UAW9 335 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 NKAIN4Q8IVV8 208 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 GIMAP5Q96F15 307 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 C19orf43Q9BQ61 176 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 NICN1Q9BSH3 213 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 MFFQ9GZY8 342 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC23A2Q9UGH3 650 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 SPDEFO95238 335 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 MRGPRX1Q96LB2 322 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GV50 99 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 NID1P14543 1247 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 EPHA1P21709 976 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP2CBP62714 309 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP2CAP67775 309 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 TATDN3Q17R31 274 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ELP2Q6IA86 826 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 RTL6Q6ICC9 239 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 LILRB2Q8N423 598 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 FNDC9Q8TBE3 224 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 SDF2Q99470 211 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 PBDC1Q9BVG4 233 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ACER3Q9NUN7 267 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-201ENST00000418331 ARAP2Q8WZ64 1704 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 NUP205Q92621 2012 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 ARRB2P32121 409 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 DLSTP36957 453 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 DLX5P56178 289 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 MPEG1Q2M385 716 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 APOOLQ6UXV4 268 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 OR6F1Q8NGZ6 308 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 CHST8Q9H2A9 424 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 NOX4Q9NPH5 578 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 STRCQ7RTU9 1775 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 RFPL3O75679 317 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF1P41567 113 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 MTNR1BP49286 362 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBTB8AQ96BR9 441 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GVG6 124 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 SEC14L2O76054 403 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 GABARAPO95166 117 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC43A2Q8N370 569 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 RSPRY1Q96DX4 576 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 PKMYT1Q99640 499 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 SULF2Q8IWU5 870 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 BPIFB2Q8N4F0 458 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC35A4Q96G79 324 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-201ENST00000418331 SFXN4Q6P4A7 337 aa19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms