RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKS4BQ8N8V4 417 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 POMGNT2Q8NAT1 580 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 LZICQ8WZA0 190 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 MUCL1Q96DR8 90 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 MUS81Q96NY9 551 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 MOGAT1Q96PD6 335 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 ASPNQ9BXN1 380 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 NGBQ9NPG2 151 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 B3GAT1Q9P2W7 334 aa18.59■□□□□ 0.57
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SH3BP4-204ENST00000416021 RAD51DO75771 328 aa18.58■□□□□ 0.56
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SH3BP4-204ENST00000416021 PPA1Q15181 289 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 GABRA6Q16445 453 aa18.58■□□□□ 0.56
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SH3BP4-204ENST00000416021 OR7E24Q6IFN5 339 aa18.58■□□□□ 0.56
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SH3BP4-204ENST00000416021 TAGLN3Q9UI15 199 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 FREM1Q5H8C1 2179 aa18.58■□□□□ 0.56
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SH3BP4-204ENST00000416021 MPGP29372 298 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF426Q9BUY5 554 aa18.57■□□□□ 0.56
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SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF682O95780 498 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 CH25HO95992 272 aa18.56■□□□□ 0.56
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SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF74Q16587 644 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 NCMAPQ5T1S8 102 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 CBLL1Q75N03 491 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 SSX8Q7RTT4 187 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 VTCN1Q7Z7D3 282 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 LURAP1LQ8IV03 231 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 NKAIN4Q8IVV8 208 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 UEVLDQ8IX04 471 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 UPK3AO75631 287 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF432O94892 652 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM107AO95990 144 aa18.55■□□□□ 0.56
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SH3BP4-204ENST00000416021 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
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SH3BP4-204ENST00000416021 OR5J2Q8NH18 312 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 OR52N5Q8NH56 324 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM162AQ96A26 154 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM204Q9BSN7 226 aa18.55■□□□□ 0.56
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SH3BP4-204ENST00000416021 RCE1Q9Y256 329 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PR80 420 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 DPRXA6NFQ7 191 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC43A1O75387 559 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 OR6A2O95222 327 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 THRBP10828 461 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 CD53P19397 219 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC25A3Q00325 362 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 PUDPQ08623 228 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-204ENST00000416021 NHLRC1Q6VVB1 395 aa18.54■□□□□ 0.56
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