RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 C10orf53Q8N6V4 93 aa18.5■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 OR6S1Q8NH40 331 aa18.5■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 MFSD8Q8NHS3 518 aa18.5■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 SLC7A13Q8TCU3 470 aa18.5■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 PYDC1Q8WXC3 89 aa18.5■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 STMN2Q93045 179 aa18.5■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 PTDSS2Q9BVG9 487 aa18.5■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 FANCFQ9NPI8 374 aa18.5■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 CENPEQ02224 2701 aa18.5■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 A0A087WUU8 490 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 HTR3EA5X5Y0 456 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 CYTIPO60759 359 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 ENTPD5O75356 428 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 CGAP01215 116 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 MFSD13AQ14CX5 517 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 PFN4Q8NHR9 129 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 PIGXQ8TBF5 258 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 TAAR8Q969N4 342 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 SLC25A36Q96CQ1 311 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 ALPK1Q96QP1 1244 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 ELOVL5Q9NYP7 299 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 EMC3Q9P0I2 261 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 DNAJB9Q9UBS3 223 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa18.49■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 TUBAL3A6NHL2 446 aa18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 ENO4A6NNW6 628 aa18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 CLOCKO15516 846 aa18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 MT-ATP6P00846 226 aa18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 IGF2P01344 180 aa18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 FASP25445 335 aa18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 NRMQ8IXM6 262 aa18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 FAM222BQ8WU58 562 aa18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 SGTBQ96EQ0 304 aa18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 PSD2Q9BQI7 771 aa18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 BCO1Q9HAY6 547 aa18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 SH3PXD2BA1X283 911 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 CYSRT1A8MQ03 144 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 FTCDNL1E5RQL4 147 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 PIP5K1CO60331 668 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 E2F6O75461 281 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 BGLAPP02818 100 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 YES1P07947 543 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 IFI30P13284 250 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 PRF1P14222 555 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 POU2F1P14859 743 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 FPR1P21462 350 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 CD79BP40259 229 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 HMGA2P52926 109 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 ATP6AP1Q15904 470 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF74Q16587 644 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 TBPL2Q6SJ96 375 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 TUSC5Q8IXB3 177 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 CDK20Q8IZL9 346 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 LINC00471Q8N535 108 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF610Q8N9Z0 462 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 OR4K5Q8NGD3 323 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 FUZQ9BT04 418 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 ASPNQ9BXN1 380 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 C12orf49Q9H741 205 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM5Q9Y2B1 443 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 CORINQ9Y5Q5 1042 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 U3KQV3 271 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 CELSR2Q9HCU4 2923 aa18.47■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 MPDZO75970 2070 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF724A8MTY0 619 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 CH25HO95992 272 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 IFNGR2P38484 337 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 LIMS1P48059 325 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 TLE4Q04727 773 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 PRKCDQ05655 676 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 PDK3Q15120 406 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 SEC23BQ15437 767 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 PAQR6Q6TCH4 344 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 OR4C15Q8NGM1 316 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 BPIFA2Q96DR5 249 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 FKRPQ9H9S5 495 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 S100A14Q9HCY8 104 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 NANSQ9NR45 359 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 C20orf141Q9NUB4 165 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 VNN3Q9NY84 501 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 CRIM1Q9NZV1 1036 aa18.46■□□□□ 0.55
C4orf48-201ENST00000409248 CACNA1DQ01668 2161 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms